蓝藻门的品种分类
1971年法国斯塔尼尔等基于蓝藻在原核、细胞壁组成，脂肪酸和DNA碱基组成等特性上与细菌相近似，提出蓝藻应命名为蓝细菌。已逐渐为微生物学家、生理生化学家等所采用。但是，蓝藻具有能以水作为电子来源进行光合作用放氧，低的内源呼吸率，有限的利用有机物作为能源和碳源的能力等属于植物界的主要属性，为原有的“细菌”属性所不包容。蓝藻基本上按英国藻类学家F.E.弗里奇的分类系统，分为色球藻目(Chroococcales)、宽球藻目(Pleurocapsales)、管胞藻目(Chamaesiphonales)、念珠藻目(Nostocales)和真枝藻目(Stigonemales)等5个目。
常见的蓝藻有单细胞或群体的，如色球藻属(Chroococcus)，常生于温室的花盆上或潮湿的岩石和树干上；微囊藻属(Microcystis)，为浮游性群体，夏季大量繁殖形成“水华”，危害水生植物；丝状体的有颤藻属、念珠藻属及鱼腥藻属等（图6-1）。
色球藻属(Chroococcus)植物体为单细胞或群体。单细胞时，细胞为球形，外被固体胶质鞘。群体是由两代或多代的子细胞在一起形成的。每个细胞都有个体胶质鞘，同时还有群体胶质鞘包围着。细胞呈半球形，或四分体型。
颤藻属 (Oscillatoria) 植物体是由一列细胞组成的丝状体，不分枝，常丛生或形成团块，胶质鞘无或不明显。丝体能前后伸缩或左右摆动，因而得名。丝体中常被中空双凹形的死细胞所隔开，也产生胶化膨大、双凹形的隔离盘，两个死细胞或隔离盘之间的这一段称为藻殖段，并以藻殖段进行繁殖。多生于有机质丰富的湿地或浅水中。
念珠藻属(Nostoc) 丝状体念珠状，有的外有公共的胶质鞘包被而形成片状体。细胞圆球形，丝体上有异形细胞和厚壁孢子。以藻殖段进行繁殖。本属的地木耳、发菜、葛仙米等可供食用。
鱼腥藻属(Anabeana) 与念珠藻属很相近。丝状体单一或成团，细胞圆形，厚壁孢子圆筒形，无公共胶质鞘。满江红鱼腥藻(A. azollae Strasb.)，为一种著名的固氮蓝藻，它和一水生蕨类植物满江红（又叫红萍或绿萍）共生在一起（叶中），为水稻田的速生绿肥植物。
