如何快速掌握TCGA数据库
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tcga工作组发的文章。
The Cancer Genome Atlas (TCGA,https://tcga-data.nci.nih.gov/tcga/tcgaHome2.jsp)数据库。TCGA数据源大部分都是公开的。
目前来能够从TCGA数据库中提取数据的处理工具有cBioPortal(http://www.cbioportal.org/public-portal/cgds_r.jsp),ICGC(http://dcc.icgc.org/download/current)和GenePattern(http://www.broadinstitute.org/cancer/software/genepattern/download/index)。
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目前来能够从TCGA数据库中提取数据的处理工具有cBioPortal(http://www.cbioportal.org/public-portal/cgds_r.jsp),ICGC(http://dcc.icgc.org/download/current)和GenePattern(http://www.broadinstitute.org/cancer/software/genepattern/download/index)。
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