谁来说说Illumina 454 ABI 测序的区别
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Illumina的、Roche的、ABI的,都是二代测序技术算是。
也有一些号称为三代测序的技术,比如Pacific Biosciences的什么。主要特征是单分子测序。
二代测序虽然快,但仍然需要扩增才有足够的量来测序。而扩增过程本身不同的基因会有一定的偏好性,做基因组没问题,但做转录组测序问题就有点突出了。
三代号称都是不需要扩增,样品量极少就可以直接测的,感觉更准一样的。但实现上现在有很多问题,还不成熟。主要就是错读率还是有点高。
Metagenome、转录组什么这些,这是这些高通量测序技术的应用而已。不管用什么高通量测序技术,几乎都可以做的。
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我个人认为 俗称的ABI,还是专指一代测序,那也是ABI最风光的年代。
后来变成了Life Technologies,之后才有了Ion torrent 和proton。
目前illumina的MiSeq 读长可以到2*300 bp, 大通量的HiSeq也能到2*150 bp。已经算很长的了。
也有一些号称为三代测序的技术,比如Pacific Biosciences的什么。主要特征是单分子测序。
二代测序虽然快,但仍然需要扩增才有足够的量来测序。而扩增过程本身不同的基因会有一定的偏好性,做基因组没问题,但做转录组测序问题就有点突出了。
三代号称都是不需要扩增,样品量极少就可以直接测的,感觉更准一样的。但实现上现在有很多问题,还不成熟。主要就是错读率还是有点高。
Metagenome、转录组什么这些,这是这些高通量测序技术的应用而已。不管用什么高通量测序技术,几乎都可以做的。
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我个人认为 俗称的ABI,还是专指一代测序,那也是ABI最风光的年代。
后来变成了Life Technologies,之后才有了Ion torrent 和proton。
目前illumina的MiSeq 读长可以到2*300 bp, 大通量的HiSeq也能到2*150 bp。已经算很长的了。
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