阜阳市工商行政管理局的内设机构
办公室
负责机关文电、档案、信息、统计、保密、信访等工作；承担政务公开和机关资产管理等工作。
政治处
承办机构编制、人事管理、队伍建设和教育培训等工作；承担市辖县(市、区)工商行政管理局领导班子双重管理有关事项；指导基层队伍建设的有关工作。
财务装备科
负责机关、直属机构、派出机构和事业单位的经费、财务、装备、基本建设和国有资产管理工作；编制财务预决算；监督检查财务、基本建设管理制度执行情况。
政策法规科
组织开展工商行政执法监督和听证工作；承办行政复议、应诉和赔偿工作；承担行政执法行为监督、案件核审和法规宣传等工作。
消费者权益保护科（12315消费者申诉举报中心）
负责消费者权益保护工作；承担流通领域商品质量监督管理工作；开展有关服务领域消费维权工作；查处假冒伪劣等违法行为；承担消费者咨询、投诉、举报受理与处理、网络体系建设工作。
合同监督管理科
负责合同监督管理，查处合同欺诈等违法行为；承担动产抵押登记和拍卖行为的有关监督管理工作。
企业监督管理科
指导和监督内资企业登记注册和监督管理工作；承担企业的信用信息管理工作和年度报告公示内容的抽查工作；组织查处违反有关登记管理法规的案件。
个体私营经济监督管理科
指导和监督个体工商户、私营企业、农民专业合作社的登记注册与监督管理工作；承担个体工商户等信用信息管理工作；组织查处取缔无照经营；指导个体民营企业协会工作。
广告监督管理科
组织实施广告业发展规划和政策措施；监督管理广告活动；监测各类媒介广告发布情况；查处虚假广告等违法行为；指导广告行业组织的工作。
商标监督管理科
组织查处商标侵权行为，保护商标专用权；开展安徽省著名商标的审核申报和保护工作；负责阜阳市知名商标的认定和保护工作；依法保护驰名商标、地理标志商标、特殊标志和官方标志。
机关党委
负责机关和直属（派出）单位的党群工作。
监察室
负责本局党的纪律检查和行政监察工作。
离退休管理办公室
负责机关离退休人员的服务管理工作 。
