Question

基因工程中，为什么切质粒和切目的基因要用同种限制酶？

用同种限制酶说明质粒里面也有和目的基因一样的基因，那么直接从质粒里面提取目的基因不就行了？
2楼的说到“限制酶识别的是碱基对序列的顺序而不是基因种类”，获取目的基因的细胞和质粒必须都有相同的碱基对序列才能用同一种酶切割，而基因就是碱基对的排列顺序，那么岂不是说获取目的基因的细胞和质粒都具有的那个相同的碱基对序列就是目的基因？为什么不是两者均有目的基因？

Answer 1

质粒里面含有一段人为添加的多克隆位点，用于多种内切酶的识别，目的基因通常是从cDNA上PCR下来的，在设计PCR引物的时候会在前后加上所需的内切酶识别序列，这样用同样的内切酶处理质粒和目的基因后，就可以在两端留下互补的粘性末端，再用连接酶处理就可以把目的基因连到质粒上

Answer 2

好吧，咱先从啥是基因开始说起吧。目前我们普遍所说的基因是只具有功能的DNA序列，所以并不是所有的DNA序列都能叫基因。
然后我们再讨论你的问题
楼上的人已经解释的很清楚了，用同一种限制酶的目的就是让质粒和目的基因方便连接。为此，甚至人为的在目的基因两头加上酶切所需的限制酶识别切割序列（酶切位点），以方便切割。这样将目的基因和质粒连接后，就方便了后续的实验研究需要（如大量扩增的需要，蛋白的表达等）。

Answer 3

''用同种限制酶说明质粒里面也有和目的基因一样的基因'' 这样说是不正确的。
限制酶识别的是碱基对序列的顺序而不是“基因种类”。
用同样的限制酶处理目的基因和质粒是为了产生相同的粘性末端，以便可以将两者连接起来（原理是：碱基对互补配对）。

Answer 4

同种限制酶切识别某一种特定的碱基序列，酶切后不同的质粒和目的基因可以获得相同的粘性末端，便于质粒和目的基因相连接。

Answer 5

质粒存在于细胞质，但是相对于细胞核，质粒所含的DNA较少，所以在质粒中能提取到的目的基因很少，甚至可能没有，毕竟质粒中只含有少量的DNA片段。
而且，相比细胞核，质粒的体积很小，在基因工程中，作业难度较大。