如何提取DNA粗提和精提的方法
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一、DNA提取(粗提取)
1、酚抽提法:先用蛋酶K、SDS破碎细胞,消化蛋白,然后用酚和酚-氯DNA大小为100-150kb
2、甲酰胺解聚法:破碎细胞同上,然后用高浓度甲酰胺解聚蛋白质与DNA的结合,再透析获得DNA可得DNA200kb左右。
3、玻璃棒缠绕法:用盐酸胍裂解细胞,将裂解物铺于乙醇上,然后用带钩或U型玻璃棒在界面轻搅,DNA沉淀液绕于玻棒。生成DNA约80kb。
4、异丙醇沉淀法:基本同1法,仅用二倍容积异丙醇替代乙醇,可去除小分子RNA(在异丙醇中可溶状态)
5、表面活性剂快速制备法:用Triton X-100A或NP40表面活性剂破碎细胞,然后用蛋白酶K或酚去除蛋白,乙醇沉淀或透析。
6、加热法快速制备:加热96℃-100℃,五分钟,然后离心后取上清,可用于PCR反应。
7、碱变性快速制备:先用NaOH作用20分钟,再加HCI中和,离心后取上清,含少量DNA。
二、DNA的浓缩(精提取)
1、固体聚乙二醇(PEG)浓缩:用透析袋外敷PEG至合适量。
2、丁醇抽提浓缩:DNA溶液中水可分配到正丁醇或仲丁醇,但DNA不会。因此重复几次可显著减少DNA体积。
3、乙醇或异丙醇沉淀:(1)需要阳离子盐的存在,NaAc最常用,NaCl对含SDS样品好,NH4Ac去除dNTP好。PiCl沉淀RNA好,但不能用于反转录前。(2)沉淀温度与时间;0℃一4℃,12000g,10分钟,小于100bp DNA需超速离心。
4、精胺沉淀法:与DNA结合后使DNA结构凝缩沉淀,需在无盐或低盐溶液。
1、酚抽提法:先用蛋酶K、SDS破碎细胞,消化蛋白,然后用酚和酚-氯DNA大小为100-150kb
2、甲酰胺解聚法:破碎细胞同上,然后用高浓度甲酰胺解聚蛋白质与DNA的结合,再透析获得DNA可得DNA200kb左右。
3、玻璃棒缠绕法:用盐酸胍裂解细胞,将裂解物铺于乙醇上,然后用带钩或U型玻璃棒在界面轻搅,DNA沉淀液绕于玻棒。生成DNA约80kb。
4、异丙醇沉淀法:基本同1法,仅用二倍容积异丙醇替代乙醇,可去除小分子RNA(在异丙醇中可溶状态)
5、表面活性剂快速制备法:用Triton X-100A或NP40表面活性剂破碎细胞,然后用蛋白酶K或酚去除蛋白,乙醇沉淀或透析。
6、加热法快速制备:加热96℃-100℃,五分钟,然后离心后取上清,可用于PCR反应。
7、碱变性快速制备:先用NaOH作用20分钟,再加HCI中和,离心后取上清,含少量DNA。
二、DNA的浓缩(精提取)
1、固体聚乙二醇(PEG)浓缩:用透析袋外敷PEG至合适量。
2、丁醇抽提浓缩:DNA溶液中水可分配到正丁醇或仲丁醇,但DNA不会。因此重复几次可显著减少DNA体积。
3、乙醇或异丙醇沉淀:(1)需要阳离子盐的存在,NaAc最常用,NaCl对含SDS样品好,NH4Ac去除dNTP好。PiCl沉淀RNA好,但不能用于反转录前。(2)沉淀温度与时间;0℃一4℃,12000g,10分钟,小于100bp DNA需超速离心。
4、精胺沉淀法:与DNA结合后使DNA结构凝缩沉淀,需在无盐或低盐溶液。
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