Question

原子是物质吗？？如果是，那么为什么又说物质是由分子构成的？？

Answer 1

同一个词在不同的语境中可能有不同的含义，这在日常生活中是很常见的，科学中也不例外，尽管为追求严谨，人们尽可能用准确的定义和语言去消除歧义，但中学及以下阶段这常常会显得繁琐。
原子当然属于物质的范畴，这里的物质指与精神或意识相对的一个哲学概念。
而说物质是由分子构成的时候，这里的物质是狭义的，就是指人们司空见惯的宏观物质。
微观粒子不是宏观物质，但是物质是无疑的。
如有不明欢迎追问和讨论。

Answer 2

物质是宏观概念．
原子，分子都是微观概念．
前后两者不能用"是"来连接．
应该这样说：
物质由分子构成，分子由原子构成．
当你观察"单个"的分子和原子时，就已经不能用宏观的"物质"概念来表达了．