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推荐于2016-08-28
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RT-PCR步骤
总RNA提取
1. 取200mg组织,放到1.5ml EP管中,加入1ml Trizol剪碎。
2. 震荡30s。
3. 加0.2ml氯仿,剧烈摇动30s,室温3min。
4. 12000×g,4℃ 离心,15min。
5. 吸上层无色水相,移入另一EP管中(约0.5ml)。
6. 加等体积异丙醇,-20℃,30min。
7. 12000×g,4℃ 离心,10min。在管底部可见微量RNA沉淀
8. 弃上清,加75%乙醇1ml,振荡。
9. 7500×g,4℃ 离心,10min。
10. 弃上清,用滤纸小心吸取残留液体,室温干燥5-10min。
11. 沉淀溶于20μl DEPC水,取1μl加入79μl DEPC水测OD260/OD280
12. 计算浓度与纯度,-70℃保存。
OD260×40×稀释倍数
RNA浓度(μg/μl)=————————————
1000
逆转录合成 cDNA
反应体系如下
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
MgCl2 2μl
10×RT Buffer 1μl
RNase Free dH2O 3.75μl
dNTP Mixture(各10mM) 1μl
RNase Inhibitor 0.25μl
AMV Reverse Transcriptase 0.5μl
Random 9 mers 0.5μl
Positive Control RNA (1μg) 1μl
混匀快速离心一次
反应条件如下
30℃ 10min
42℃ 30min
99℃ 5min
5℃ 5min
-20℃ 冰箱冻存
PCR反应
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
摸板cDNA 2.5μl
5×PCR Buffer 2.5μl
灭菌蒸馏水 7.2μl
聚合酶 Ex Taq HS 0.1μl
上游引物 0.1μl
下游引物 0.1μl
—————————————————————————————
Total 12.5μl
混匀快速离心一次
反应条件
94℃ 2min 1Cycle
94℃ 40sec ┓
50-65℃ 40sec ┃ 25-35Cycles
72℃ 1min ┛
72℃ 5min 1Cycle
PCR产物-20℃冰箱保存
取PCR产物8μl 加5×Loading Buffer 2μl 2%琼脂糖凝胶电泳120V
100mA 30min 溴化乙锭染色,凝胶成象仪成象并保存结果
总RNA提取
1. 取200mg组织,放到1.5ml EP管中,加入1ml Trizol剪碎。
2. 震荡30s。
3. 加0.2ml氯仿,剧烈摇动30s,室温3min。
4. 12000×g,4℃ 离心,15min。
5. 吸上层无色水相,移入另一EP管中(约0.5ml)。
6. 加等体积异丙醇,-20℃,30min。
7. 12000×g,4℃ 离心,10min。在管底部可见微量RNA沉淀
8. 弃上清,加75%乙醇1ml,振荡。
9. 7500×g,4℃ 离心,10min。
10. 弃上清,用滤纸小心吸取残留液体,室温干燥5-10min。
11. 沉淀溶于20μl DEPC水,取1μl加入79μl DEPC水测OD260/OD280
12. 计算浓度与纯度,-70℃保存。
OD260×40×稀释倍数
RNA浓度(μg/μl)=————————————
1000
逆转录合成 cDNA
反应体系如下
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
MgCl2 2μl
10×RT Buffer 1μl
RNase Free dH2O 3.75μl
dNTP Mixture(各10mM) 1μl
RNase Inhibitor 0.25μl
AMV Reverse Transcriptase 0.5μl
Random 9 mers 0.5μl
Positive Control RNA (1μg) 1μl
混匀快速离心一次
反应条件如下
30℃ 10min
42℃ 30min
99℃ 5min
5℃ 5min
-20℃ 冰箱冻存
PCR反应
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
摸板cDNA 2.5μl
5×PCR Buffer 2.5μl
灭菌蒸馏水 7.2μl
聚合酶 Ex Taq HS 0.1μl
上游引物 0.1μl
下游引物 0.1μl
—————————————————————————————
Total 12.5μl
混匀快速离心一次
反应条件
94℃ 2min 1Cycle
94℃ 40sec ┓
50-65℃ 40sec ┃ 25-35Cycles
72℃ 1min ┛
72℃ 5min 1Cycle
PCR产物-20℃冰箱保存
取PCR产物8μl 加5×Loading Buffer 2μl 2%琼脂糖凝胶电泳120V
100mA 30min 溴化乙锭染色,凝胶成象仪成象并保存结果
GRS塑料
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