Question

同时对一个物种进行转录组测序和建立cDNA文库有什么好处？

相比单独只做转录组或单独只做cDNA文库而言。

回答好可加分。

谢谢。

Answer 1

转录组即特定细胞在大迹某一功能状态下所能转录出来的所有 RNA 的总和， 是研 究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是，转录组的定义中包含了 时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下，其基因表达情况 是不完全相同的。环境微生物生态多样性研究中的突出优势体现在： （1） 测序序列长，便于聚类拼接，可以对转录本进行从头组装（de novo assembly）。滚谨并 （2） 测序通量高，可以检测到低丰度转录本信息。 （3） 可以对无基因组参考序列的新物种进行转录组测序，发现新的转录本和亚 型。 （4） 实验操作简单、结果稳定，可重晌迅复性强。无需进行克隆的文库构建，双链 cDNA 连接 454 接头后可以直接进行测序，实验周期短。 （5） 测序数据便于进行生物信息分析，可以进行基因差异表达分析、鉴定基因 的可变剪切以及预测新基因。

追问

那相比之下，cDNA文库的优点又是什么呢？谢谢。

追答

基因组含有的基因在特定的组织细胞中只有一部分表达，而且处在不同环境条件、不同分化时期的细胞其基因表达的种类和强度也不尽相同，所以cDNA文库具有组织细胞特异性。cDNA文库显然比基因组DNA文库小得多，能够比较容易从中筛选克隆得到细胞特异表达的基因。

Answer 2

cDNA相比于转录组的优点册谈是包含有该物种的全部转录本，可以便捷的克隆该物种的所需基因，而枯姿仿不必考虑时空表达的差异。

转录组的优点在于是某个特定时期的所有转录产物，可以用来研究某一生理条件或时空条件下该物种转录水平和正常情况没纤下的差异。

话说昨晚似乎回答过你的这个问题。

Answer 3

cDNA相比于转录组的优点是包含有该物种的全冲宴部转录本，可以便捷和圆的克唤判塌隆该物种的所需基因，而不必考虑时空表达的差异。