Question

如何分析PCR扩增后的电泳图？

在鉴定细菌的分类是，我们通常是采用16SrRNA的方法，当我们通过PCR扩增后，在琼脂糖凝胶板电泳得到的电泳图，如何分析电泳图，以判断我们DNA的提取成功？

Answer 1

在电泳的时候加上DNA的分子量marker，一般16S的大小都是1.5 kb吧（很久不做了，记不太清楚）。如果有明显的目的条带而且大小也合适的话那就一般不会错，如果想要确定，可以将条带从胶中切下来，回收之后送去测序，就可以知道序列的详细信息了。

另外你的目的如果只是判断DNA的提取是否成功的话，那么在提取DNA之后直接跑电泳就可以了，没有必要做PCR扩增16S。一般细菌基因组都在15～16k大小左右。

Answer 2

判断DNA提取成功不是通过PCR扩增之后的电泳结果来判断，而是在提取DNA之后立刻进行电泳来检测在23kb处是否有一条亮而无拖尾的条带。您所说的检测16SrRNA是否被成功扩增，应该将PCR产物上凝胶电泳，看1.6kb处是否有条带就行。

Answer 3

细菌DNA提取后，电泳80V，20min，点样孔附件有边缘锋利的条带，不弥散，基本可以认为提取DNA较好。有大分子量得Marker更好，不过一般不需要。
PCR产物当然需要与Marker比对以确定大小，大小正确，剩余产物送测序。