一、组织不同
1、亚太经合组织
亚洲太平洋经济合作组织（英文名称Asia-Pacific Economic Cooperation，英文缩写APEC），简称亚太经合组织，是亚太地区重要的经济合作论坛，也是亚太地区最高级别的政府间经济合作机制。其官方顾问机构是环太平洋大学联盟。
2、上海合作组织
上海合作组织，简称上合组织，是中华人民共和国、哈萨克斯坦共和国、吉尔吉斯斯坦共和国、俄罗斯联邦、塔吉克斯坦共和国、乌兹别克斯坦共和国于2001年6月15日在中国上海宣布成立的永久性政府间国际组织。
二、成立背景不同
1、亚太经合组织
亚太经合作组织诞生于全球冷战结束的年代。20世纪80年代末，随着冷战的结束，国际形势日趋缓和，经济全球化、贸易投资自由化和区域集团化的趋势渐成为潮流。同时，亚洲地区在世界经济中的比重也明显上升。
2、上海合作组织
上海合作组织起源于1996年，是中国、俄罗斯、哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦的关于加强边境地区信任和裁军的谈判进程的组织。上海合作组织是第一个以中国城市命名的国际组织，它进一步加强了中国与周边国家的关系。
三、作用地位不同
1、亚太经合组织
亚太经合组织总人口达26亿，约占世界人口的40%；国内生产总值之和超过19万亿美元，约占世界的56%；贸易额约占世界总量的48%。这一组织在全球经济活动中具有举足轻重的地位。
自成立以来，亚太经合组织在推动区域和全球范围的贸易投资自由化和便利化、开展经济技术合作方面不断取得进展，为加强区域经济合作、促进亚太地区经济发展和共同繁荣做出了突出贡献。
2、上海合作组织
上海合作组织奉行对外开放的原则，致力于同其他国家和国际组织开展各种形式的对话、交流与合作。上海合作组织已与联合国、东南亚国家联盟、独立国家联合体、阿富汗建立了正式联系。
2004年12月，上海合作组织获得联合国大会观察员地位。2005年4月中下旬，上海合作组织秘书处分别与独联体执委会和东盟秘书处签署了谅解备忘录。
参考资料来源：百度百科-上海合作组织
参考资料来源：百度百科-亚太经合组织
上合组织是一个区域内的综合组织，以政治、军事、反恐为主。
2、亚太经合组织在世界上的影响力是上合组织不能比的。
亚太经合组织的成员国的人口和经济总量占世界全部的一半以上，而上合组织在世界上的影响力很有限
3、相比亚太经合组织，上合组织的发起，中国起了非常关键的作用。
