故事开始在地中海的里斯本，主人公拉斐尔为证明自己出海周游世界。在的黎波里附近遇海雷丁，与他同盟。亚历山大收到铁礼列后可装二层装甲。伊斯坦堡同业公会让我去亚洲找药，在杭州同业公会买到华佗的中药后交给他，出现遗迹，得黄铜制煤油灯。在雅典得知霸者之证线索在非洲，来到非洲。
在圣乔治接到命令回里斯本，在里斯本王宫，阿博科鲁克提督让我与西鲁韦拉合作消灭埃斯皮诺沙商会。回圣乔治，酒吧女让我找高丽青瓷香炉给她，在卢安达附近遇海盗，打败海盗后得高丽青瓷香炉，交给酒吧女，出现遗迹，得神秘石板上半部。
向埃斯皮诺沙宣战，打败他后得知非洲总督府搬到索法拉，到索法拉，西鲁韦拉把我在索法拉的占有率抢走，向他宣战，胜之得神秘的石板下半部。
去印度洋，索哥德拉的码头遇伍丁，他约我在巴斯拉的同业公会见。在巴斯拉与伍丁结盟对付纳哥普尔。
巴斯拉的酒吧女要求我去找陶瓷的耳环，在卡利亥特的同业公会买到后交给她，出现遗迹。到附近的港口的酒馆里得知巴斯拉酒馆老板找，回巴斯拉，他让我去救遗迹中被诅咒的人，第二次去酒馆他告诉我救人必须要有某一种香料和天方夜谭。
在非洲买到乳香，带着天方夜谭去巴斯拉遗迹，得贵霜朝的大盘。在势力第一时伍丁会给我不枯萎的莲叶。
去东南亚，阿镇出港时得知葡萄牙投降了西班牙，但决定先不回去。在麻六甲，普雷依拉让我先去东亚取霸者之证。把誓言戒指的剧本(易安在卡利亥特广场得到)交给酒吧女，出现遗迹，如果有印度洋的霸者之证可得古代王国钱币。
到东亚，在澳门，李华梅让我帮她消灭来岛，作为交换她会给我细竹编的绘图。在泉州广场，奇怪的老人看了我非洲的霸者之证后让我去山东南部找忽必烈的大刀(南纬34东经120)。在大阪和来岛冲突，交战，胜之得知李华梅在杭州。
在杭州，她给我竹艺品的组合说明书。把细雪的长袍(斯德哥尔摩的同业公会买到)交给大阪的酒吧女，她让我去印度买纱布，买来纱布后又让我去地中海买葡萄酒(都只要一个船舱)，买来后出现遗迹金阁寺，和尚告诉我霸者之证的线索在东北的村庄。
到科尔夫(北纬60东经165)，途中可在北海道补给一下(北纬42东经141)，得唐代的竹艺品。
带着东亚霸者之证(或只要竹艺品的组合说明书即可)回麻六甲，普雷依拉让我去地中海打败巴鲁迪斯积累经验，再回来打库恩。
到地中海，在里斯本决定与巴鲁迪斯决战，国王召见，告诉我集齐七个霸者之证葡萄牙即可独立。到塞尔维亚与西班牙贵族冲突，约定海上见。出港即交战(此仗非常难打，前后共有四支舰队，建议先存档)，胜之得画有图案的布。
回东南亚，向库恩宣战，胜之得装有乳液的壶。
到新大陆，在哈瓦那同业公会，村民让我去遗迹，但要先找托拉洛克的小刀(北纬22西经97)，找到后去广场，村民传授我工夫。去遗迹得到典礼用的小刀。在哈瓦那和委拉克路斯的码头分别听到新大陆两大势力将联合对付我，向他们宣战。
势力第一时可得太阳圆纹的刀鞘。在哈瓦那上方有一条航线，沿着上去发现城市朋沙科拉，见到夏洛特。第二次去时决定帮她建交易所，到伯南布哥买来一个船舱木材，在委拉克路斯买来一个船舱玉蜀忝后，去别的城市转一圈，过一个月再去(船上必须有货物)，
发生剧情，出现交易所，不断投资后总督府，旅馆，广场，造船厂等都陆续出现。到哈瓦那的旅馆，看到夏洛特给我的信，让我等葡萄牙脱离西班牙统治后再去找她。
去北海，把彩虹色的玻璃珠交给伦敦的酒吧女，在码头得知伦敦同业公会找。去同业公会，老板让我去遗迹查探。从遗迹出来后依次去码头，酒馆，码头，遗迹，得老旧的羊皮纸。势力和金钱第一后去阿姆斯特丹，丽璐给我红色的染料。
找齐七个霸者之证后去里斯本王宫出现结局画面。
扩展资料：
大航海4拉斐尔人物设定：
葡萄牙中产阶级出身。是家中的次子，有一个年长很多的哥哥。由于父亲年纪很大才有了他，所以收到百般呵护。他喜欢父母、哥哥还有家里的仆人，觉得非常需要他们，但是因为大家对自己过于照顾，所以渐渐想要尽快独立。兴趣是拉小提琴和读书。
向往骑士般的传奇和冒险。和库拉乌迪10岁时就认识。库拉乌迪的父亲来拉斐尔家工作时，为了让库拉乌迪学习和帮忙，把他也带来了。
库拉乌迪看见拉斐尔拿着书，说“我知道比那还有趣的故事”，然后把他从父亲那里听到的稀奇古怪的故事绘声绘影的讲给拉斐尔听。从此开始了他们的交情。
地中海（一）
出海后到达休达，在码头有一段教学剧情，之后回里斯本再出港时，弗利奥会要求去雅典找些东西（没有这段剧情直接去雅典也行）。
来到雅典，汉斯和阿尔加迪斯两师徒加入拉斐尔一行，并提到了霸者之证。拉斐尔很是心动，决定去寻找，汉斯提供情报，说有人把霸者之证的地图带到了非洲南面。
第一次遇到海雷丁第一舰队时如果弗利奥在主舰队，会发生剧情，海雷丁觉得拉斐尔说话很有意思，决定与他结盟。之后入港大家觉得地中海太危险了，不适合发展，弗利奥建议先把这里的人才招齐。
与海雷丁结盟后第一次遇到巴鲁迪斯第一舰队时，巴鲁迪斯会恐吓拉斐尔，海雷丁赶来解围，拉斐尔逃过一劫。
这个时候，如果消灭或威压巴鲁迪斯，且地中海势力第一的话，进港后会得到“画有图案的布”。但个人不建议这么做，因为这样一来后面会损失大量剧情。
非洲
第一次进入非洲港口的交易所，会触发阿尔加迪斯的女性身份事件。
在圣乔治入港时，汉斯会提醒拉斐尔要注意各地的遗迹，方便寻找霸者之证。进入圣乔治后，有人会通知拉斐尔回里斯本，阿博科鲁克有请。
进入里斯本王宫，在阿博科鲁克的撮合下，拉斐尔与西鲁韦拉达成了对抗埃斯皮诺沙的同盟，并得到赞助费5万。
第一次与埃斯皮诺沙第一舰队作战时，西鲁韦拉会来帮忙。
消灭埃斯皮诺沙（威压的话则无西鲁韦拉剧情），进入索法拉时发生剧情，西鲁韦拉窃取了拉斐尔的功劳，成为了非洲总督，只给了拉斐尔象征性的3000块。之后，拉斐尔失去在索法拉的全部占有率，且西鲁韦拉占有索法拉的50%。
消灭或威压西鲁韦拉及埃斯皮诺沙，且非洲势力第一时，进入圣乔治或索法拉会发生剧情，当地人民感谢拉斐尔除掉了两个恶棍，送出“神秘的石版下半部”。
进入圣乔治的遗迹即可得到“神秘的石版上半部”，打开该遗迹有两种方法：
1、非洲势力值1000时，圣乔治同业公会请拉斐尔去地中海讨伐海盗朱里安·菲米尔，完成后公会将帮你开启；
2、送给圣乔治酒吧女“高丽的青瓷香炉”，再进酒馆时她会帮你开启。
而得到“高丽的青瓷香炉”也有两种方法：
1、在圣乔治酒馆“喝一杯”若干次，酒吧女会告诉你喜欢这东西，然后去东亚挖掘（北36 东126）；
2、认识圣乔治酒吧女后，在非洲势力值200以上时进入酒馆，她会告诉你附近有海盗。此时非洲地图上出现一支海盗舰队，战胜后即可得到香炉，该舰队大概会存在两个月左右的时间，如果错过了就去东亚挖掘吧。
在码头组合两者，即得到“贝利安德罗的石地图”，按着它找到“阿克斯姆王的金印”。
找到非洲霸者之证后，拉斐尔决定前往印度洋。
非洲势力值1000时，索法拉同业公会请拉斐尔去锡兰捉拿强·拉姆吉欧。
印度洋
进入除巴斯拉外的阿拉伯港口，在码头会碰见伍丁，他邀请你去巴斯拉，此时出现选项：1、是不能拒绝；2、觉得他有点恐怖，停止吧！
选择1则要去巴斯拉，选择2则无任何事件发生。如果选择1的话，去到巴斯拉同业公会，伍丁会请你与他结盟，并给你一个晚上的时间考虑。再次进入公会，将出现选项：1、我接受同盟；2、还不能接受同盟。
选择1则与伍丁同盟并与纳哥普尔开战，如果之前拉斐尔在马斯喀特和索哥德拉没有占有率，则各得到1%的占有率；选择2则无任何事件发生。
印度洋势力第一且与伍丁为非战争状态时，进港时伍丁会送你“不枯萎的莲叶”。
印度洋势力值2000，且送过巴斯拉酒吧女礼物，则在除巴斯拉以外的港口酒馆会得到通知：巴斯拉的酒馆老板有请。进入巴斯拉酒馆，老板请你调查该城的遗迹，地图在索法拉买。到了遗迹后发现无法进入，回酒馆得到情报：需要一舱乳香（摩加迪休）、天方夜谭（伊斯坦堡）、阿尔在主舰队。满足条件后再进入遗迹即得到“贵霜朝的大盘”。
在码头，拉斐尔组合不了两件证物，杰拿斯在主舰队时，可以旅馆得到帮助，将两件证物组合成“梭伦的叶地图”，按着它找到“吠陀本集”。
如果已知道阿尔加迪斯是女性，在印度港口入港时会发生埃米利奥受伤，阿尔加迪斯探病时库拉乌迪吃醋的剧情。
如果与伍丁开战，在第一次遇到伍丁第一舰队时，伍丁会说：“没想到我们会成为对手……”
东南亚势力值1500时，阿芝莎将随机出现。
东南亚（一）
第一次进入东南亚港口，有人会提醒拉斐尔要小心普雷依拉和库恩的斗争。
如果巴鲁迪斯未被消灭或威压，则在第一次进入除麻六甲外的东南亚港口时，拉斐尔收到急报：西班牙吞并了葡萄牙。大家都认为现在回国也无济于事，弗利奥建议找附近的普雷依拉结盟。
进入麻六甲码头，普雷依拉出现，他对拉斐尔的要求不置可否，要求他先去东亚发展。
如果由于过早地消灭或威压巴鲁迪斯导致以上剧情无法触发，则可以通过消灭库恩后进港得到“装有乳液的壶”。
东亚
进入中国的港口，李华梅会请你消灭来岛，拉斐尔表示同意。
进入大阪后来岛会来勒索，行久出现并制止，之后加入，拉斐尔与来岛开战。开战后出港，来岛的第一、第二舰队会在港外守株待兔，出现铁甲船事件。
消灭来岛（威压无效），进入杭州后李华梅会送你“竹艺品的组合说明图”。
送礼给大阪酒吧女后，她会要求看纱布（加尔各答），然后要求喝葡萄酒（马德拉），完成后她会开启遗迹，地图在卡利亥特买。进入遗迹后高僧让拉斐尔去科尔夫（北60 东165）找“唐代的竹艺品”。
由杰拿斯或乙凤在酒馆组合两者，即得到“科以伦的竹地图”，按着它找到“秦始皇的长信宫灯”。
如果已经知道阿尔加迪斯是女性，在京城会有她看见库拉乌迪与小孩玩的剧情。
找到东亚霸者之证后，拉斐尔认为可以去找普雷依拉了。
东亚势力值1000时，杭州同业公会请拉斐尔讨伐海盗柏列特·佩罗。
东南亚（二）
持有“唐代的竹艺品”、“竹艺品的组合说明图”和“科以伦的竹地图”三者中任意一样，且巴鲁迪斯未被消灭或威压同时库恩还存在，进入东南亚印度支那港口，普雷依拉会出现并有选项：1、抢占了葡萄牙的西班牙；2、……不太明白。
选择1则普雷依拉送出“装有乳液的壶”，并再次出现选项：A、首先要打倒库恩；B、库恩的事就拜托你了。
选择A的话则与普雷依拉结盟并与库恩开战；选择B的话则只会结盟。无论选择A与B，在消灭库恩之后进入麻六甲普雷依拉都会送你50万酬劳。
选择2的话，则与普雷依拉结盟，在消灭库恩之后进港会得到“装有乳液的壶”。
持有印度洋霸者之证，进入麻六甲遗迹后即得到“古代王国钱币”，打开该遗迹有两种方法：
1、送给麻六甲酒吧女“誓言戒指的剧本”，再进入酒馆时她会帮你开启；
2、东南亚势力值1800时，麻六甲同业公会请拉斐尔讨伐海盗贝拉肯苏·阿基列，完成任务后公会将帮你开启。
在酒馆组合两者，即得到“毕阿斯的货币地图”，按着它找到“库德里的永久护符”。
北海
第一次与丽璐舰队相遇时，对方会用旗语请拉斐尔去阿姆斯特丹。进入阿姆斯特丹，丽璐会警告拉姆尔不要插手北海商圈。出港后拉斐尔遭到海盗维路斯的袭击（音效而已），众人迅速逃离该海域。
第一次进入北欧港口时，会触发塞拉在海边听拉斐尔拉小提琴的剧情。
北海势力第一时，进入阿姆斯特丹丽璐会送出“红色的染料”。
北海势力值700，且送过伦敦酒吧女礼物时，伦敦同业公会将请拉斐尔去调查该城的遗迹，地图在阿姆斯特丹买。进入后发现邪教在举行仪式，回来后在码头大家都想不出办法。进入酒馆得到情报，并在码头想清楚了问题，再进入遗迹即得到“老旧的羊皮纸”。
在码头组合两者，即得到“泰勒斯的纸地图”，按着它找到“狩猎神乌尔的弓箭”。
北海势力值1200时，汉堡同业公会请拉斐尔去非洲讨伐海盗杰克斯·勃鲁姆。
认识斯德哥尔摩的酒吧女后，在北海势力值1000以上时进入酒馆，她会请你去哈瓦那酒馆捉拿伽布利厄·杜儿卡齐，得到“冰冻的玫瑰”。
新大陆
如果已经知道阿尔加迪斯是女性，在第一次进入非加勒比港口时会发生拉斐尔与库拉乌迪的吵架事件。之后在地中海会有两人的谅解事件。
第一次进入哈瓦那酒馆时，拉斐尔会和库拉乌迪讨论新大陆的形势，酒馆老板会来插话，出现选项：1、打倒玛尔德纳德；2、怎么办……选择哪个都无所谓，全是没效果的。
第一次进入委拉克路斯码头时，会听到芬与手下的对话，得知埃斯康特打算联合玛尔德纳德对付拉斐尔。之后进入哈瓦那码头，会得知新大陆的两大势力关系很恶劣。
新大陆势力第一时，进港会得到“太阳图纹的刀鞘”。
新大陆势力值1000时，哈瓦那同业公会请拉斐尔去寻找“托拉洛克的小刀”（北22 西97），找到后进入哈瓦那广场，会进行一星期的剑术训练。之后遗迹开启，地图在委拉克路斯买。进入遗迹即得到“典礼用的小刀”。
在码头组合两者，即得到“比塔科史的刀刃地图”，按着它找到“水晶头盖骨”。库拉乌迪很怕这东西。
新大陆势力值1500时，委拉克路斯同业公会请拉斐尔讨伐海盗维廉·克莱布。
如果格尔哈特在主舰队，则在第一次与玛尔德纳德第二舰队战斗后会有他和维路斯的对话。
夏洛特剧情：
进入朋沙科拉，杰拿斯与阿尔加迪斯在主舰队时，遇到夏洛特被人欺负，拉斐尔英雄救美。
第二次进入朋沙科拉，拉斐尔建议建设一个交易所，需要一舱木材。运到后开始建造。
进入新大陆其他港口的交易所，拉斐尔决定在朋沙科拉引进玉蜀黍。
得知阿尔加迪斯是女性后，运一舱玉蜀黍到朋沙科拉，夏洛特请拉斐尔去她家做客。
如果已经发生西班牙吞并葡萄牙的剧情，那么在地中海进港后返回朋沙科拉，将触发丰收祭的剧情，对话中会提到这个事件。之后朋沙科拉出现交易所。
进入任意港口的旅馆，阿尔加迪斯会安慰拉斐尔。
地中海（二）
如果已经在东南亚做过普雷依拉的“多项选择题”，那么进入里斯本时，人们会传播拉斐尔与巴鲁迪斯决战的消息。之后进入王宫，得知复国需要所有的霸者之证。
如果已经触发西班牙吞并葡萄牙的剧情，那么进入塞尔维亚时会发生西门要求决斗，巴鲁迪斯制止并约定海上解决的事件。只有发生过里斯本事件后，才会在塞尔维亚出港时引发车轮大战。
巴鲁迪斯的几个舰队和阿博科鲁克会与拉斐尔战斗两场，必须全胜才能在战斗后得到“画有图案的布”，如果战败或者逃脱，则需要地中海势力第一时进港才能得到。
取得车轮大战的胜利后，进入里斯本王宫会得到国王的表扬，拉斐尔继续寻找霸者之证。
地中海势力值1000时，伊斯坦堡同业公会请拉斐尔寻找“华佗的中药”（杭州），完成后开启遗迹，地图在雅典买。进入后得到“黄铜制的煤油灯”。
在码头组合两者，即得到“库雷欧布罗的布地图”，按着它找到“肯毕西斯的王冠”。
如果以前与海雷丁有结盟剧情，则在东南亚做完“多项选择题”后进入的黎波里或亚力山卓，海雷丁会让你去阿尔及尔。进入阿尔及尔，海雷丁送给拉斐尔一艘战列舰，让他去对付巴夏，并提醒成功后去亚历山卓的遗迹。消灭巴夏后进入该遗迹，得到“背德魔铠”。
地中海势力值1200时，里斯本同业公会请拉斐尔去莫三比克捉拿雅可布·勃特朗。
地中海势力值2000时，热那亚同业公会请拉斐尔讨伐海盗芝加诺斯·贝。
集齐七个证后，就回里斯本看结局吧。
