perl 不同文件按列合并
很多个如图所示txt文件,要做的通过比对是把前面四列相同的取出来放到一个新的文件中,第五列的频率值按列放到新文件中,效果如图每个txt文件有前四列相同的行,也有不同的,程...
很多个如图所示txt文件,要做的通过比对是把前面四列相同的取出来放到一个新的文件中,第五列的频率值按列放到新文件中,效果如图
每个 txt 文件有前四列相同的行,也有不同的,程序要做的就是输出所有 txt 文件前四列相同的行,对应的频率值按顺序排列在第 5 列,第 6 列,第 7 列 。。。求大神指点,左图是要比对的输入文件,右图是想要达到的效果图。急,求大神指点! 展开
每个 txt 文件有前四列相同的行,也有不同的,程序要做的就是输出所有 txt 文件前四列相同的行,对应的频率值按顺序排列在第 5 列,第 6 列,第 7 列 。。。求大神指点,左图是要比对的输入文件,右图是想要达到的效果图。急,求大神指点! 展开
2个回答
展开全部
my %elm;
my @files = <*.txt>;
for my $f(@files){merge($f);}
save("final.log");
sub merge{
my $f = shift;
my $H;
open $H, $f;
<$H>;
while (<$H>) {
chomp;
my @e = split(/[ \t]/, $_);
my $k = join(',', @e[0..2]);
$elm{$k} = [] if (!exists $elm{$k});
push @{$elm{$k}}, $e[3];
}
}
sub save {
my $out = shift;
my $H;
open $H, '+>', $out;
print $H "CHROM\tpos\tref\tfreq\n";
for my $k(keys %elm) {
print $H join("\t", split(',', $k), @{$elm{$k}}) . "\n";
}
close $H;
}
追问
输出文件应该放哪,我还是一个 perl 小白,还有就是好像 25 行有语法错误,报错了,求指点,麻烦您了1
推荐律师服务:
若未解决您的问题,请您详细描述您的问题,通过百度律临进行免费专业咨询