mapping在生物信息学中含义?
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Gene mapping, also called genome mapping, is the creation of a genetic map assigning DNA fragments to chromosomes.
这是英文定义,说白了就是绘制遗传图谱的过程。
而mapping就是绘制图谱的意思,还有physical mapping,就是绘制物理图谱。
When a genome is first investigated, this map is nonexistentThe map improves with the scientific progress and is perfect when the genomic DNA sequencing of the species has been completed. During this process, and for the investigation of differences in strain, the fragments are identified by small tags.. 当人类第一次接触某个基因组时,它的图谱是不存在的。而随着科研的进行与深入,当该物种的DNA编码已经完全破解后,它的图谱也就逐渐完善直至完整。在这个过程中,对生物的基因进行鉴定,以此测定它的染色体上的特定位置,然后用图示的方式把它表示出来,就形成了基因图谱。
这是英文定义,说白了就是绘制遗传图谱的过程。
而mapping就是绘制图谱的意思,还有physical mapping,就是绘制物理图谱。
When a genome is first investigated, this map is nonexistentThe map improves with the scientific progress and is perfect when the genomic DNA sequencing of the species has been completed. During this process, and for the investigation of differences in strain, the fragments are identified by small tags.. 当人类第一次接触某个基因组时,它的图谱是不存在的。而随着科研的进行与深入,当该物种的DNA编码已经完全破解后,它的图谱也就逐渐完善直至完整。在这个过程中,对生物的基因进行鉴定,以此测定它的染色体上的特定位置,然后用图示的方式把它表示出来,就形成了基因图谱。
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那大侠拜托再帮我解释下bowtie和samtools,谢谢
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这两个都是数据分析工具,我估计有点像数据库操做系统。
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Bowtie,为了对序列进行数据分析,由Steven Salzberg(约翰霍普金斯大学医学院)的研究小组开发的基因组装配或比对软件
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SAM (Sequence Alignment/Map) format 核苷酸序列对位排列/ 图谱格式
SAM (Sequence Alignment/Map) format is a generic format for storing large nucleotide sequence alignments.
核苷酸序列对位排列/ 图谱格式是一个为了存储大型核苷酸序列排列或图谱的通用格式。
至于SAM Tools provide various utilities for manipulating alignments in the SAM format, including sorting, merging, indexing and generating alignments in a per-position format.
SAM Tools这个工具就是能在SAM格式中操作序列,包括分类,合并,索引,在一个对应格式中生成序列。
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