超级机器人大战A的隐藏要素共有4条线，分别如下：
1、 漆黑勇者特急与黑加尔
(1)第14话结束后选择分支路线B：返回日本。
(2)第17话B结束前旋风寺舞人、猛兽先锋、防卫列车的击毁数合计大于50。达成条件后第17话结束进入隐藏剧情《黑色勇者特急》。
(3)满足以上条件，西历世界路线第28话B加入(选择其他分支路线会在合流后加入)。
2、ZZ高达(全装甲)
(1)第22话结束后选择分支路线A：与朗德·贝尔接触。
(2)第23话A用捷多与马利坦战斗之后用捷多和巴纳吉说得玛莉妲。
(3)第36话前捷多达成ACE驾驶员(击毁数≥60)。
(3)满足以上条件，第36话捷多会驾驶ZZ高达(全装甲)出击。如果未满足以上条件也会在第50话B加入。
3、汉穆拉比与亚赞、盖布尔
(1)第22话结束后选择分支路线A：与朗德·贝尔接触。
(2)第25话A用捷多击毁亚赞。
(3)第36话前捷多达成ACE驾驶员(击毁数≥60)
(4)第36话结束后选择分支路线B：宇宙部队编成。
(5)第37话B用卡缪击毁亚赞。
(6)满足以上条件，第40话加入。如未满足以上条件也会在第50话B加入。
4、拜亚兰特装型与杰利特·梅萨
(1)第36话用卡缪击毁杰利特。
(2)第36话结束后选择分支路线B：宇宙部队编成。
(3)第37话B用卡缪击毁杰利特。
(4)满足以上条件，第40话加入。如未满足以上条件也会在第50话B加入。
游戏背景介绍
新西元187年，也就是反对联邦政府的蒂帕茵·库尔塞依达斯“DC战争”与异星人的“L5战役”之后半年。地球联邦政府不得不重新组织剩余力量，任命布莱恩·米德克利得为联邦政府大统领，而后通过联邦会议公开了“L5战役”的结果。
会上一个被称为“东京宣言”的言论公开承认了地球以外有生命体存在，并威胁到人类的生命。
布莱恩·米德克利得希望全世界联合起来，并发表了关于联邦军的架构改编和军备增强的“イージス计划”，在这个计划的名义下大量生产人形兵器，并强化地球防卫能力。为此许多势力如比安博士率领的蒂帕茵·库尔塞依达斯，DC残党等都开始蠢蠢欲动，地球的人类又将陷入一场危机了。
（1）全装甲高达与G装甲：第7话过关后，阿姆罗的击坠数大于塞拉，得到全装甲高达；塞拉的击坠数大于阿姆罗，得到G装甲。
（2）夏亚专用红勇士：第7话击坠夏亚，过关后得到。
（3）拉拉：宇宙路线第9话阿姆罗分别与夏亚和拉拉交战，第11话阿姆罗和塞拉都分别与夏亚和拉拉交战（与拉拉交战前绝对不要像某错误攻略那样先击坠夏亚，必须在夏亚活着的情况下，先和夏亚交战再和拉拉交战），第12话先击坠夏亚再由阿姆罗说得拉拉。
（4）隐藏资金：第7话塞拉与夏亚交战发生对话，过关后获得资金奖励（最开始时用机体围住夏亚，等大部队出现后立刻让塞拉与夏亚交战）。
机动战士高达08小队：
（1）艾娜：第6话斯罗说得艾娜，第7话不击坠艾娜，过关后艾娜带着阿普萨拉斯和高机动试作型扎古加入。
（2）诺利斯：第28话将诺利斯以外的敌人全灭，过关后加入。
机动战士高达0083：无隐藏
机动战士Z高达：
凤与罗莎美：第18话由卡缪说得其中一个人并击坠，过关加入（两人二选一，与之前的路线分支没有任何关系）。
机动战士ZZ高达:
（1）普露：第28话先击坠格雷米，让卡缪与普露交战，二人都生存的话，普露立即加入。
（2）普露兹：第28话，普露加入后，由普露击坠普露兹，过关加入。
（3）全装甲ZZ高达：第31话后选择小巴姆星路线，第35话前捷多的击坠数达到5以上。
机动战士高达逆袭的夏亚:
沙扎比：第31话过关后夏亚的击坠数达到30以上。
机动战士W高达：无隐藏
机动战士G高达：
（1）阿伦比：第18话由多蒙说得，第19话先由铃、再由多蒙说得，最后由多蒙击坠（不能用地图武器），过关后加入。
（2）东方不败与风云再起：第8话选择地上路线，第16话后分支选择基亚纳高地，第19话成功说得阿伦比，第28话后多蒙的击坠数达到30以上，第29话东方不败与风云再起一起加入（之前最好都用多蒙击坠东方不败）。若上述条件未满足，则东方不败不能入手，第21话过关时多蒙击坠数达到30以上，第22话风云再起加入。
魔神Z：
（1）BOSS机器人追加武器：第8话选择去宇宙，第10话前BOSS的击坠数达到5以上。
（2）米妮鲁芭X：第7话打到暗黑大将军之前由兜甲儿说得，之后变为NPC，保护它过关后得到。
大魔神：
量产型大魔神：第30话过关后剑铁也的击坠数达到30以上。
UFO魔神：
基莉嘉：第24话，由宇门大介与基莉嘉交战，将ズリル的增援母舰击坠后，由大介说得加入（说得时大介的机体不能与玛利亚的机体合体）。
盖塔系列：
（1）巴武藏不死：第15话前流龙马的击坠数达到15以上，15话过关后巴武藏幸存。
（2）莉莎：超级系路线第4话过关后流龙马的击坠数达到5以上。
（3）美雪：第7话让流龙马、神隼人和巴武藏分别与美雪驾驶的盖塔Q交战，之后由龙马说得加入。
（4）铁甲鬼：第15话保护NPC铁甲鬼过关。
（5）蝴蝶鬼：第16话过关后分支选择去大鸟岛基地（ビックファルコンへ行く），第17话流龙马和蝴蝶鬼交战，二人都生存的话，由龙马说得加入。
龙骑：
苍鹰马约：第30话过关后若林健的击坠数达到30以上，第31话加入。
日月双煞：无隐藏
超电磁与斗将：
（1）小青蛙：第16话过关后分支选择南原研究所，第17话加入。
（2）孔巴德拉V追加武装：第16话过关后分支选择南原研究所，第28话追加。
（3）波鲁迪斯V追加武装：第16话过关后分支选择大鸟岛基地，第28话追加。
（4）斗将追加武装：第16话过关后分支选择基亚纳高地，第28话追加。
机动战舰：
（1）大豪寺凯：第8话选择宇宙路线，第9话保证凯、明人和抚子号不被击坠，避免凯死亡剧情的发生，第11话加入。
（2）白鸟九十九：第31话后选择木连路线，第33话加入。
（1）第6话中，让西罗（シロー）说得爱娜（アイナ）（击坠或者让她逃跑都可以）。
（2）第7话中，不击坠她，让她生存到过关的话就能成为同伴。
シャア専用ゲルググ
第7话时击坠シャア就可以得到。
美雪（ミユキ）
第7话中按照竜马（ゲッター1）、隼人（ゲッター2）、弁庆（ゲッター3）的顺序与她发生战斗。然后再让竜马去说得，过关后就可以成为同伴。
米那鲁巴X（ミネルバX）
第7话中，打倒暗黒大将军之前让甲児说得ミネルバX。如果让它生存到过关，过关后就可以成为同伴。
全装甲高达（フルアーマーガンダム）orG装甲（Gアーマー）
第8话为止塞拉（セイラ）的击坠数比阿姆罗（アムロ）多的话就会得到机体Gアーマー。
胡蝶鬼（メカ胡蝶鬼）
（1）第16话后分支选择“ビックファルコンへ行く”。
（2）让メカ胡蝶鬼与ゲッタードラゴン交战后两者都不要被击坠，然后再让竜马说得就可以成为同伴。
凤（フォウ＝ムラサメ）or罗莎米亚（ロザミア＝バダム）
（1）第16话中用卡谬（カミーユ）说得。二人都能够说得。
（2）第18话中卡谬（カミーユ）说得然后将她击坠。
戴莫斯（ダイモス）的追加武装：必杀烈风正拳突き改
第17话的时候去“ギアナ高地”就会追加。
柀Ψ讲粩ˉ蕙攻咯`アジア（マスターガンダム）
（1）第8话中选择地上。在以后的剧情中用多蒙（ドモン）与魔鬼高达（デビルガンダム）和尊者高达（マスターガンダム）发生战斗，并打倒魔鬼高达（デビルガンダム）和尊者高达（マスターガンダム）。
（2）在兰塔欧岛（ランタオ岛）的战斗中用多蒙（ドモン）打倒东方不败（マスターアジア）。
（3）按照上文所述，让阿莲比（アレンビー）加入同伴。
阿莲比（アレンビー＝ビアズリー）（ノーベルガンダム）
（1）第18话中、用多蒙（ドモン）说得阿莲比（アレンビー）。
（2）第19话中、用铃（レイン）说得アレンビー，然后再用多蒙说得。
（3）用ドモン击坠アレンビー。过关后就可成为同伴，如果顺序错误的话是不能令其成为同伴的。
满足上面条件后在19话不让东方不败死的话第29话就会成为同伴。东方加入还需要“多蒙“击坠数超过30
风云再起（风云再起）
当东方不败（マスターアジア）在19话生存的场合，会在29话加入。
其利加（キリカ）
（1）第24话中，デューク与其利加（キリカ）战斗。
（2）击坠ズリル（除其利加（キリカ）以外全灭的人）
（3）用マリア说得（如果与グレンダイザー合体的话将无法说得）
诺里斯（ノリス＝パッカード）（グフカスタム）
（1）第28话中让爱娜（アイナ）与西罗（シロー）他进行战斗的话会发生对话。
（2）令他存活到过关就能让他成为同伴。
埃尔比布鲁（エルピー＝プル）（キュベレイMkⅡ）、
布鲁兹（プルツー）（キュベレイMkⅡ）
（1）第28话中、先将古莱明击坠（グレミー）。
（2）先让卡谬（カミーユ）与布鲁（プル）交战，双方都生存的情况下会有对话发生。
（3）然后布鲁（プル）就会成为同伴。
（4）再用布鲁（プル）击坠布鲁兹（プルツー）的话，过关后布鲁兹（プルツー）就会加入。
沙扎比（サザビー）
第31话结束的时候克瓦特罗（クワトロ）击坠数在30以上。
白鸟九十九
（1）第31话结束后选择“木连のいる方面へ向かう”。
（2）然后只需要让他不死就会正式成为伙伴（不过第22话不能出击）
全武装ZZ高达（フルアーマーZZガンダム）
（1）第31话结束后选择“小バーム星方面へ向かう”。
（2）在第36话中捷多（ジュドー）有击坠数的话ZZ高达（ΖΖガンダム）就会变成全武装ZZ高达（フルアーマーΖΖガンダム）。
