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你好，在PCR扩增中，目标片段的长度主要是由引物的特异性结合来控制的。在第一次扩增中，因为DNA两条链分别只有一条引物结合，这样taq聚合酶理论上是延伸很长的距离的，但由于我们控制了延伸时间，新合成的链不会长的非常多。所以第一次扩增得到的DNA是两条长（原始链），两条中等长（新链）。
第二次扩增反应时，引物和上次反应合成的链结合，之前上游引物指导和成的链现在在3‘端和下游引物结合，而下游指导合成的链在它的3’端上游引物结合，此时，新合成的链只会合成到上一次合成的链引物的起始处，因为这条链的5’端只有这么长。这样第二次合成的DNA，就有两条目标DNA分子长度的链（新链），和第一次合成的中等长度的链（旧链）。
第三次反应的时候，第二次反应的链再次结合引物的时候，就是我们的目标双链DNA分子了。
第二次扩增反应时，引物和上次反应合成的链结合，之前上游引物指导和成的链现在在3‘端和下游引物结合，而下游指导合成的链在它的3’端上游引物结合，此时，新合成的链只会合成到上一次合成的链引物的起始处，因为这条链的5’端只有这么长。这样第二次合成的DNA，就有两条目标DNA分子长度的链（新链），和第一次合成的中等长度的链（旧链）。
第三次反应的时候，第二次反应的链再次结合引物的时候，就是我们的目标双链DNA分子了。
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