Question

基因组高通量测序的技术发展

Answer 1

高通量测序平台(high-throughput_genome_sequence_database)　自从2005年454 Life Sciences公司（2007年该公司被Roche正式收购）推出了454 FLX焦磷酸测序平台（454 FLX pyrosequencing platform）以来，曾推出过3730xlDNA测序仪（3730xl DNA Analyzer）的Applied BioSystem（ABI）这家一直占据着测序市场最大份额的公司的领先地位就开始动摇了，因为他们的拳头产品毛细管阵列电泳测序仪系列（series capillary array electrophoresis sequencing machines）遇到了两个强有力的竞争对手，一个就是罗氏公司(Roche)的454 测序仪(Roch GS FLX sequencer)，，另一个就是2006年美国Illumina公司推出的Solexa基因组分析平台（Genome Analyzer platform），为此，2007年ABI公司推出了自主研发的SOLiD 测序仪(ABI SOLiD sequencer)。这三个测序平台即为目前高通量测序平台的代表。
在最近几年中，高通量测序技术已经由以凝胶板为基础的方法(例如“S放射标记测序手册、ABl 373、ABIPRISM 377、Li-corIR2型DNA测序仪)发展到毛细管测序仪(如ABI Prism 3100、3700和3730xl型DNA测序仪，Megabace1000和Megabace 5000)测序，已有关于制备DNA和测序的方法及设备的评论发表(Meldrum，2000a，b)。利用毛细管测序仪的转变解决了凝胶板技术内在的通路追踪问题，毛细管测序仪的自动化显著提高了处理量，同时提供了更长的可测序长度。这些进展显著增加了近些年产生的人类病原体的基因组数据。
TIGR现在的尖端测序设备包括25台ABIPrism 3700DNA分析仪、24台AppliedBiosystems 3730xlDNA分析仪、6台ABIPrism 3100DNA分析仪。约有50个项目在同时进行。在2001年进行的测序反应超过了3 400 000个，而到2002年底已完成了6 000 000个反应。TIGR现今的测序能力为每年14 000 000个测序流程。