Question

核糖体序列可以作为菌株的鉴定吗

Answer 1

微生物菌株的分子鉴定，我们要选择什么样的DNA分子呢？

他必须符合几个特点：

1. 在所有菌株中都存在，要不没法比；

2. 2. 在进化中相对保守，执行相同或相近的功能；（执行相同的功能才能在进化压力下相对保守，只有相对保守，有一个稳定的架构才能比较亲缘）

3. 3. 有一点的信息量，序列太短了信息量太少，无法很好的比较；

4. 4. 便于序列分析，（别太长了，太长了增加技术难度和准确性）

6. 核糖体是在所有细胞形式生命中都存在，而且功能相同（合成多肽链）。所以核糖体rRNA的DNA序列相对保守，是较理想的进化、亲缘分析的对象。

7. 其中5S rDNA太息量不足，；16S rDNA一般有1.5 kbp够长了；而23S rDNA太长不便分析；所以一般我们都是以16S rDNA作为菌株鉴定的分析对象