自己遇到的R语言相关问题日记
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1.Linux与R的学习先后问题:
师姐说后面作生信分析要用Linux环境进行数据集群分析,所以目前首要任务是熟悉R语言和Python的操作,后面转到Linux环境运行操作大同小异。
2.R及Rstudio的安装问题:
装了Rstudio之后显示没有装R,解决方案是R和Rstudio安装时选择默认路径,是这两个软件装在同一个目录下。
3.输入demo()后显示
> demo()
Warning message:
In file.show(outFile, delete.file = TRUE, title = paste("R", tolower(x$title))) :
file.show():不存在'C:\Users\灏忔湪浜榎AppData\Local\Temp\RtmpENM66s\RpackageIQR28b82f592cbb'这个文件
(1)找出问题:R存在一个中文目录底下,会出现错误,所以首先第一步要将文件名(即user底下的名字)改为英文的(注:以后文件名尽量设置为英文的,才方便识别)
(2)解决问题:因为win为家庭版,所以没有在计算机管理中没有找到本地用户和组,借鉴了CSDN论坛中一位大神经验贴的后半部分【 【设置】Win10如何更改C:\Users\下的用户名_胡振涛-CSDN博客_如何更改users下的用户名 】,从win+R输入regedit(打开注册表)那块开始,后面将自己中文的文件名改成英文就好了,然后注销再打开,运行R后,输入demo(),显示界面如下图。
4.options()是个啥,没整明白?
options:指定系统参数
5. runif()函数
runif (random samples from uniform distribution) 均匀分布中的随机变量
例如:runif(242, min =-0.3,max=0.3) 从-0.3 到0.3 随机产生242个值
6.包及库
1——已经安装的包
2——用来放R安装时自带的包(如base,state等)
7.函数括号内加“”的规律:外部的东西要加引号。安装以后内部的东西不用加引号。
8.批处理命令打出来很奇怪?
9.返回值?——一个运算函数被赋予具体数据后得到值return到这个函数变量上(操作型函数没有返回值)
10.help(package="vcd"/"ggplot2"),命令后help界面无显示
未找到问题原因,解决方案为在CRAN上直接看好了。
11.安装ggplot2包后,输入library(ggplot2),没有反应——说明你装上了。。(有些包library成功是没有输出的)
相反的是可以看到如果安装的是tidyverse,输入library(tidyverse),是有输出的
12.Rstudio工作路径&库安装路径修改(我用#CSDN#这个app发现了有技术含量的博客,小伙伴们求同去《Rstudio更改工作路径&安装包路径》, 一起来围观吧 https://blog.csdn.net/princessyang/article/details/105731349?utm_source=app&app_version=4.7.1&code=app_1562916241&uLinkId=usr1mkqgl919blen)
工作路径修改
getwd()——得到目前的工作路径
setwd(“目标工作路径”)
getwd()——就可以看到路径更改了
库安装路径修改
打开
13.忘了在操作台输入啥可以显示那一长条的包了?
14.数据集和数据结构
1)数据集就是多个数据组成的集合
2)数据结构就是数据集的结构
15.rep函数
rep(1:4, each = 2)——1到4,每个element循环2次
[1] 1 1 2 2 3 3 4 4
rep(1:4, c(2,2,2,2))——1到4,对应位置上的element循环2次
[1] 1 1 2 2 3 3 4 4
rep(1:4, c(2,1,2,1))——1到4,对应位置上的element有的循环1次,有的循环2次
[1] 1 1 2 3 3 4
16.rep(1,40*(1-.8))什么意思?
就是说1这个数字,重复40*(1-0.8)=8遍,但其实只重复7遍,因为计算机返回的结果比8稍小一点。
如果想要得到循环8次,可以使用这个函数:rep(1,round(40*(1-.8)))
17.矩阵
(1)只有在数据长度不是矩阵行数或者列数整数倍的时候才会报错,在矩阵列数X行数所需数据大于数据长度时,会再次重复排列数据,但不会报错。
(2)矩阵默认按照 列 的顺序来排列数据,
matrix(x,5,byrow = T) 按照 行 的顺序排列
matrix(x,5,byrow = F) 按照 列 的顺序排列
(3)以字符型向量添加行名和列名
> rnames <- c("R1","R2","R3","R4")
> cnames <- c("C1","C2","C3","C4","C5")
> dimnames(m) <- list(rnames,cnames)
(4)矩阵汇总
(5)矩阵索引
y[1,2]——y矩阵中第1行,第2列
18.数组
师姐说后面作生信分析要用Linux环境进行数据集群分析,所以目前首要任务是熟悉R语言和Python的操作,后面转到Linux环境运行操作大同小异。
2.R及Rstudio的安装问题:
装了Rstudio之后显示没有装R,解决方案是R和Rstudio安装时选择默认路径,是这两个软件装在同一个目录下。
3.输入demo()后显示
> demo()
Warning message:
In file.show(outFile, delete.file = TRUE, title = paste("R", tolower(x$title))) :
file.show():不存在'C:\Users\灏忔湪浜榎AppData\Local\Temp\RtmpENM66s\RpackageIQR28b82f592cbb'这个文件
(1)找出问题:R存在一个中文目录底下,会出现错误,所以首先第一步要将文件名(即user底下的名字)改为英文的(注:以后文件名尽量设置为英文的,才方便识别)
(2)解决问题:因为win为家庭版,所以没有在计算机管理中没有找到本地用户和组,借鉴了CSDN论坛中一位大神经验贴的后半部分【 【设置】Win10如何更改C:\Users\下的用户名_胡振涛-CSDN博客_如何更改users下的用户名 】,从win+R输入regedit(打开注册表)那块开始,后面将自己中文的文件名改成英文就好了,然后注销再打开,运行R后,输入demo(),显示界面如下图。
4.options()是个啥,没整明白?
options:指定系统参数
5. runif()函数
runif (random samples from uniform distribution) 均匀分布中的随机变量
例如:runif(242, min =-0.3,max=0.3) 从-0.3 到0.3 随机产生242个值
6.包及库
1——已经安装的包
2——用来放R安装时自带的包(如base,state等)
7.函数括号内加“”的规律:外部的东西要加引号。安装以后内部的东西不用加引号。
8.批处理命令打出来很奇怪?
9.返回值?——一个运算函数被赋予具体数据后得到值return到这个函数变量上(操作型函数没有返回值)
10.help(package="vcd"/"ggplot2"),命令后help界面无显示
未找到问题原因,解决方案为在CRAN上直接看好了。
11.安装ggplot2包后,输入library(ggplot2),没有反应——说明你装上了。。(有些包library成功是没有输出的)
相反的是可以看到如果安装的是tidyverse,输入library(tidyverse),是有输出的
12.Rstudio工作路径&库安装路径修改(我用#CSDN#这个app发现了有技术含量的博客,小伙伴们求同去《Rstudio更改工作路径&安装包路径》, 一起来围观吧 https://blog.csdn.net/princessyang/article/details/105731349?utm_source=app&app_version=4.7.1&code=app_1562916241&uLinkId=usr1mkqgl919blen)
工作路径修改
getwd()——得到目前的工作路径
setwd(“目标工作路径”)
getwd()——就可以看到路径更改了
库安装路径修改
打开
13.忘了在操作台输入啥可以显示那一长条的包了?
14.数据集和数据结构
1)数据集就是多个数据组成的集合
2)数据结构就是数据集的结构
15.rep函数
rep(1:4, each = 2)——1到4,每个element循环2次
[1] 1 1 2 2 3 3 4 4
rep(1:4, c(2,2,2,2))——1到4,对应位置上的element循环2次
[1] 1 1 2 2 3 3 4 4
rep(1:4, c(2,1,2,1))——1到4,对应位置上的element有的循环1次,有的循环2次
[1] 1 1 2 3 3 4
16.rep(1,40*(1-.8))什么意思?
就是说1这个数字,重复40*(1-0.8)=8遍,但其实只重复7遍,因为计算机返回的结果比8稍小一点。
如果想要得到循环8次,可以使用这个函数:rep(1,round(40*(1-.8)))
17.矩阵
(1)只有在数据长度不是矩阵行数或者列数整数倍的时候才会报错,在矩阵列数X行数所需数据大于数据长度时,会再次重复排列数据,但不会报错。
(2)矩阵默认按照 列 的顺序来排列数据,
matrix(x,5,byrow = T) 按照 行 的顺序排列
matrix(x,5,byrow = F) 按照 列 的顺序排列
(3)以字符型向量添加行名和列名
> rnames <- c("R1","R2","R3","R4")
> cnames <- c("C1","C2","C3","C4","C5")
> dimnames(m) <- list(rnames,cnames)
(4)矩阵汇总
(5)矩阵索引
y[1,2]——y矩阵中第1行,第2列
18.数组
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