Question

如何在NCBI上查到某个给定基因的序列，并且在序列中清楚的显示出其中的外显子和内含子？

请专业人士帮忙，小妹谢谢啦！

Answer 1

1、首先输入基因的完整学名，找到与基因相关的cDNA序列。在这一cRNA序列的解说信息里，就已经有各外显子的分节。
2、将该cDNA输入Blast进行序列比对，就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置，这些信息就显示了所有的外显子。处于外显子两端的序列就是内含子。
3、如你需要完整的基因序列，需要在blast中选择others这个数据库，然后查找相关的Bac质粒中含有你完整基因的文件，在其中找到你所需的信息。

追问

没有人补充回答这个问题么？

追答

如果你是一个学习生物学、医学的研究生，你这个看不懂的话，你可以退学了，或者需要恶补下相关知识，因为你知道的太少了。如果你是本科或者以下，那就止步于此吧，那不是你需要涉足的地方。

Answer 2

在NCBI上的OMIM数据库输入基因名，在TITLE上就会显示它的学名。

用学名检索基因是比较靠谱的。建议用ENSEMBL找基因，显示其外显子和内含子。进入ENSEMBL的方法有两种，1.NCBI上进入基因的检索条以后，summary里会有相应的ENSEMBL的链接（see related）；2.直接进入ENSEMBL主页检索该基因。进入基因的检索条以后，点左侧的CDNA和EXONS就能相应地看到转录本的注释信息，包括外显子和内含子的注释，5‘和3’UTR的注释，和密码子的注释。