在ncbi上我搜到了一个蛋白~我如何知道这个蛋白有没有3d结构?
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所有的蛋白都有3D结构。如果想看的话可以在ncbi该蛋白的基因页面里找到UniProtKB的链接,再从UniProt里的Cross-references找到3D structure databases。
不放心的话,可以在string啦,或者其他的数据库中找相关的链接,看看有没有PDB的相关标号,就是4位由数字和字母混合成的晶体结构标号。
几方面一综合,就知道有没有了。不过如果不是关键蛋白质的话不要抱太大的希望,结晶难度很大,所以存在的晶体结构不是很多的,没有晶体结构的3D结构都是预测或者推测的,不作数。
NCBI上对于这些同源蛋白的名字已经有了明确的规定了,可以去NCBI上搜索这些蛋白,结果里会包含这些蛋白的详细信息,包括碱基序列,氨基酸序列等。
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所有的蛋白都有3D结构。
如果想看的话可以在ncbi该蛋白的基因页面里找到UniProtKB的链接,再从UniProt里的Cross-references找到3D structure databases。当然不是所有的蛋白都有基于实验结果的3D结构图
如果想看的话可以在ncbi该蛋白的基因页面里找到UniProtKB的链接,再从UniProt里的Cross-references找到3D structure databases。当然不是所有的蛋白都有基于实验结果的3D结构图
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楼上的看起来很厉害的样子,不过可惜显然不是专业人士。如果这个蛋白有基于实验数据的三维结构,会在显眼的地方看到PDB数据库的链接。
全球唯一合法登记生物分子高级结构的数据库网站http://www.rcsb.org
全球唯一合法登记生物分子高级结构的数据库网站http://www.rcsb.org
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楼上可行
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