在开始运行中输入msconfig没有引导，是设置错误造成的，解决方法如下：
1、首先右键点击屏幕左下角的开始按钮，在弹出菜单中选择运行的菜单项。
2、接着在打开的运行窗口中，输入命令msconfig后，点击确定按钮运行该命令。
3、然后在打开的系统配置的页面中，点击“引导”的选项卡。
4、接下来在打开的引导的窗口中。找到安全引导的设置项。
5、然后勾选该设置项前面的复选框，同时还可以选择最小与引导日志前面的复选框，最后点击确定按钮就可以了。
按如下步骤判断并修复：
点击“开始”，点击“运行”，在对话框输入栏内输入引号内字符"c:\windows\system32\msconfig.exe"，确认无误后回车（或点击“确定”）：
1、如果依然不能打开或弹出系统配置对话框，则基本可判定系统严重损坏或中毒（即系统文件意外丢失、损坏或遭病毒感染），建议方法如下：
1.1 先杀毒，杀毒后执行系统修复。鉴于本机杀毒软件并未成功拦截或阻止病毒侵袭及破坏，请使用其它更专业的杀毒软件，或检查本机杀毒软件的病毒库最后更新日期并下载最新病毒库。无论如何，必须确保本机没有病毒或已成功清除病毒。
1.2 请使用光盘重新安装系统。这是最可靠的办法。当然，如有并能确定本机系统的镜像文件是安全的，亦可使用镜像文件恢复系统。
2、如果能够打开或弹出系统配置对话框，则说明系统的环境变量被意外修改或破坏：
2.1 如果确定本机最近从未修改过环境变量，如果修改过，请还原（不会还原系统环境变量的可参照2.2及以下步骤）。如未修改过，请参照上述之1.1条执行。发现并清除病毒后（发现病毒清除不了请另行提问，或遵照1.2条执行，所有问题均可安全解决），或者没有发现病毒，请转下一步：
2.2 点击“开始”，鼠标移动到计算机图标上单击右键，单击其菜单上的“属性”，在弹出的对话框的左侧选项中单击“高级系统属性”，便会看到如下对话框：
2.3 在该对话框中，单击环境变量（红圈标注的部位），便进入环境变量修改对话框，如下图所示：
2.4 点击（红色箭头指向的）Path项目，单击“编辑”，开始修改系统变量，如下图所示：
2.5 在“变量值(V)”输入栏所有字符的最后面输入引号内字符“;%systemroot%\system32”。注意前面的“分号”是英文字符，上图在正常情况下的图例，后面也同样有英文字符的“分号”，输入无误后（建议从此拷贝以免出错），点击“确定”退出，注意接下来的每个对话框均需逐一点击“确定”退出（没有此按钮的可直接关闭）。
3、至此，在“开始”-“运行”中输入msconfig便可直接打开系统配置对话框了。（由于windows的版本缘故，个别版本需要重新启动才能使新的环境变量生效）
在Windows XP系统下，运行“msconfig”后，系统提示找不到该文件。但是该文件明明存在于系统分区中，而且可以双击打开。
A：
这是因为msconfig.exe存在于 %systemroot%\PCHealth\HelpCtr\Binaries 目录中，而不是 %systemroot% 或 %systemroot%\system32 ，无法省略其路径而直接运行文件名打开。我们平时之所以能够直接运行msconfig打开该程序，是因为在注册表中的
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\App Paths
键下有msconfig.exe 的相关路径，起到导向功能。如果没有了msconfig.exe相关路径或者路径错误，就会导致无法直接运行文件名打开。解决方法：运行“regedit”，找到
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\App Paths
在右边窗口中，右击空白处，依次选择【新建】→【项】，将其名改为“MSCONFIG.EXE”。然后选中“MSCONFIG.EXE”，再在右边窗口中，双击字符串值【默认】，把数值改为“C:\Windows\PCHealth\HelpCtr\Binaries\MSConfig.exe”(根据系统所在分区自行更改)。修改后，我们就可以像以前一样直接运行msconfig打开该程序啦。
如果2000系统要用msconfig也可以，将XP的MSCONFIG.EXE复制到C:/WINNT/SYSTEM32下就可以。
参考资料： http://zhidao.baidu.com/question/7941917.html?an=0&si=4
点击“开始”，点击“运行”，在对话框输入栏内输入引号内字符"c:\windows\system32\msconfig.exe"，确认无误后回车（或点击“确定”）：
1、如果依然不能打开或弹出系统配置对话框，则基本可判定系统严重损坏或中毒（即系统文件意外丢失、损坏或遭病毒感染），建议方法如下：
1.1 先杀毒，杀毒后执行系统修复。鉴于本机杀毒软件并未成功拦截或阻止病毒侵袭及破坏，请使用其它更专业的杀毒软件，或检查本机杀毒软件的病毒库最后更新日期并下载最新病毒库。无论如何，必须确保本机没有病毒或已成功清除病毒。
1.2 请使用光盘重新安装系统。这是最可靠的办法。当然，如有并能确定本机系统的镜像文件是安全的，亦可使用镜像文件恢复系统。
