像素处理在imageJ中怎样运行
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1、载入图像,选择菜单ImageJ→Type→8-bi,t将彩色图像变为8位灰度图像。
2、选择菜单ImageJ→Adujst→Threshold,选择合适的分割阈值,直到阈值化后的图像中所有细胞都呈高亮显示为止,然后单击“Apply“按钮,则整幅图像变为白色背景上只有细胞的二值图像,在较高版本的ImageJ中有预设值,对于跳虫计数来说“triangle”模式相对较为合适,并且在计数过程中,要将高亮设置为红色而不是黑白对照,这样才能在接下的步骤中顺利进行。
3、选择菜单ImageJ→Analyze→Analyze particles…,在弹出的成分分析设置窗口输入要计数的最大和最小细胞的像素数、细胞按大小分群的群数和分析结果的显示方式等选项,然后单击“OK”,软件自动计数和标记所有符合要求的跳虫。
最后就是保存结果啦。
总结下子,ImageJ软件固然好用,其对图片本身的要求也较高,光线要均匀,培养基质与培养物的色差要明显,这样才能在后期的处理过程中减少工作量。
还需进一步解决的问题依然是存在的,在较少工作量的基础上为了获得清晰地图片,在拍摄过程中,就必须处理好放大倍数和视野大小两者的矛盾,但目前没有找到很好的契合点,不知是不是要在硬件上有所改动~~也就是说,会不会有种在相机有这样的功能,放大倍数提高的同时,视野范围不变呢~~~~~?
2、选择菜单ImageJ→Adujst→Threshold,选择合适的分割阈值,直到阈值化后的图像中所有细胞都呈高亮显示为止,然后单击“Apply“按钮,则整幅图像变为白色背景上只有细胞的二值图像,在较高版本的ImageJ中有预设值,对于跳虫计数来说“triangle”模式相对较为合适,并且在计数过程中,要将高亮设置为红色而不是黑白对照,这样才能在接下的步骤中顺利进行。
3、选择菜单ImageJ→Analyze→Analyze particles…,在弹出的成分分析设置窗口输入要计数的最大和最小细胞的像素数、细胞按大小分群的群数和分析结果的显示方式等选项,然后单击“OK”,软件自动计数和标记所有符合要求的跳虫。
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总结下子,ImageJ软件固然好用,其对图片本身的要求也较高,光线要均匀,培养基质与培养物的色差要明显,这样才能在后期的处理过程中减少工作量。
还需进一步解决的问题依然是存在的,在较少工作量的基础上为了获得清晰地图片,在拍摄过程中,就必须处理好放大倍数和视野大小两者的矛盾,但目前没有找到很好的契合点,不知是不是要在硬件上有所改动~~也就是说,会不会有种在相机有这样的功能,放大倍数提高的同时,视野范围不变呢~~~~~?
ZESTRON
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