Question

简述检测蛋白质磷酸化的检测方法及其原理

提两个问题,希望有大侠解答:
1简述检测蛋白质磷酸化的检测方法及其原理
2简述蛋白质相互作用的检测方法及其原理
希望能详细点

高分重酬
没人能给出直接回答?

Answer 1

方法及原理：
1.激酶活性分析
生物学样品中的激酶活性通常是在体外测定的，在ATP的存在下将免疫沉淀的激酶与外源底物共同孵育。之后通过一些报告系统来评估特定激酶对底物的磷酸化，包括显色、放射性或荧光检测。
直接测定蛋白磷酸化的一种经典方法是将整个细胞与放射性标记的32P-磷酸盐共同孵育，获得细胞提取物，通过SDS-PAGE分离，并曝光在胶片上。这种繁琐的方法需要多次几小时的孵育，且使用放射性同位素。其他传统方法包括2D凝胶电泳，这种技术假定磷酸化会改变蛋白的迁移率和等电点。
2.WesternBlot
利用SDS-PAGE分离生物样品，随后转移到膜上（通常是PVDF或尼龙膜），之后利用磷酸化特异的抗体来鉴定目的蛋白。
由于测得的磷酸化蛋白水平可能随处理或凝胶上样误差而变化，研究人员常常利用一个抗体来检测同源蛋白的总水平（而不考虑磷酸化状态），以确定磷酸化组分相对于总组分的比例，并充当上样内对照。化学发光和显色法都很常用，而分子量marker常用来提供蛋白分子量的信息。
3.酶联免疫吸附分析（ELISA）
ELISA的定量能力优于Westernblot，且在调节激酶活性和功能的研究中表现出巨大的作用。这种微孔板形式的分析一般利用目的蛋白特异的捕获抗体，与磷酸化状态无关。随后让目的蛋白结合在抗体包被的分析板中，目的蛋白可以是纯的，也可以是复杂的异质样品（如细胞裂解液）中的一个组分。加入待分析的磷酸化位点特异的检测抗体。这些分析通常设计为显色或荧光检测。
4.基于细胞的ELISA
来自目的蛋白的信号可通过第二种蛋白来标准化，校正各孔之间的差异，实现磷酸化蛋白水平的准确评估，并比较多个样品，与传统免疫印迹中使用磷酸化特异和总蛋白抗体相似。这些分析绕过了制备细胞裂解液的需要，因此更适合高通量分析。
5.质谱
首先，磷酸化肽段的信号通常较弱，因为它们带负电荷，而电喷雾质谱在正电模式下作用，因此电离效果不好。其次，在大量非磷酸化蛋白的高背景之下，很难观察到低丰度目的蛋白的信号。
6.多个分析物图谱分析

Answer 2

1 磷酸化检测可以用二级质谱啊，在正离子模式下，经过collision cell后中性丢失了98dalton（ser和thr）或216dalton（tyr）的肽段就可能是含一个磷酸化位点的磷酸化肽段。
2 基本原理就是设计个bait将目的蛋白留在柱子上或沉淀下来。

Answer 3

1、我看过一篇外文文献，上面有提到直接用SDS-PAGE观察是否磷酸化，对照组将待测蛋白的磷酸化酶（不是磷酸酯酶）失活，试验组保证磷酸化酶处于活性状态，之后比较两待测蛋白的电泳结果，通常试验组会出现紧挨着的两条带。
2、pull down(见本人的百度空间，一下自己搜一下，不再赘述）
immunoprecipitation
yeast two-hybrid
phage display
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