4个回答
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阴性对照的作用就是来判断实验是否有污染的,如果PCR条带和阴性对照都弥散的话,原因应该是污染。污染一般有试剂的污染,也有可能是环境的污染。
先说试剂的污染。你设置的阴性对照所用的每一种试剂都存在被污染的可能,最实际也最麻烦的方法就是,每次更换一种试剂,重复实验,从而确定那种试剂发生污染。你提到的不加引物不弥散,那是必然的结果,及时所有试剂都发生了污染,不加入引物,扩增也是没办法进行的,结果也不会有条带。
再说环境的污染。环境的污染一般就是指气溶胶的污染,PCR实验室多少都会存在这种问题,气溶胶是比较难以消除的。先假设你所用的试剂都是正常的,你可以选择两到三对PCR产物片段较长的引物做试验(比你此次出问题的实验所选的要长),进行正常PCR,电泳看结果是如何,如果不出现弥散现象,可初步判断为气溶胶污染。接着选两到三对产物片段较短的做实验(同上),观察结果,如果同样出现弥散现象,此时可断定确实是气溶胶污染。
以上所说,属于理想状态,首先要排除个人操作失误,另外具体的情况再具体分析!
个人理解,希望对你有帮助!
先说试剂的污染。你设置的阴性对照所用的每一种试剂都存在被污染的可能,最实际也最麻烦的方法就是,每次更换一种试剂,重复实验,从而确定那种试剂发生污染。你提到的不加引物不弥散,那是必然的结果,及时所有试剂都发生了污染,不加入引物,扩增也是没办法进行的,结果也不会有条带。
再说环境的污染。环境的污染一般就是指气溶胶的污染,PCR实验室多少都会存在这种问题,气溶胶是比较难以消除的。先假设你所用的试剂都是正常的,你可以选择两到三对PCR产物片段较长的引物做试验(比你此次出问题的实验所选的要长),进行正常PCR,电泳看结果是如何,如果不出现弥散现象,可初步判断为气溶胶污染。接着选两到三对产物片段较短的做实验(同上),观察结果,如果同样出现弥散现象,此时可断定确实是气溶胶污染。
以上所说,属于理想状态,首先要排除个人操作失误,另外具体的情况再具体分析!
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追问
我用同样的试剂换一对引物PCR,有清晰的条带,证明试剂没有问题。考虑你说的气溶胶污染,我换个地方再加样一次试试。有了结果再向你请教啊。非常感谢了。
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降低电压 跑慢点
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是跑出的条带很糊么?如果是的话,按照你说的阴性对照也弥散应该是引物的问题,也有可能是PCR试剂的问题,还有可能是退火温度的问题。逐个排除吧。
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引物有无污染,跑个电泳看看
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