Question

iTunes能不能备份应用程序？还是备份应用程序的数据？

Answer 1

可以备份应用程序，以及应用程序里缓存的内容，只对于正规渠道下载的正版软件有效。
你从快用，91助手等之类的下载安装的软件，或者是你越狱后安装的软件都不会被备份。
iTunes的备份只对你从applestore里面下载的东西有效。
如果你有越狱安装的软件什么的需要备份，就用什么91助手备份，还有快用里面的备份就可以了，91的更完善，可以同时备份你的所有软件，正版盗版的都OK

不包括软件：itunes备份的对象是：短信、图片之类的；简单地说备份的数据是：不是通过itunes和APPstore下载的软件数据：
ios的设备：不管是刷机、升级、越狱：里面的软件将会全部丢失：剩下的是ios设备自带的软件：

通过pp安装的要以后重新安装的 你可以先itunes备份，备份内容是所有的软件里的自己的数据和你的通讯录等等，软件数据包括pp安装的，但是程序本身不会被备份的，然后传输购买项，这个时候是传程序和你用apple id买的其他电脑里没的东西回来，但是pp装的不是你买的，传不回来的 新机器到手，恢复itunes备份，自动重启后不要动手机，应该会自动安装电脑里和备份里有关的程序的，装完了用pp装程序，然后为了保险，可以再恢复次备份，把pp的程序的那些数据恢复回来（我不保证第一次恢复备份会同时恢复pp的程序的数据）。