Question

质粒DNA分子具有几种构象

Answer 1

超螺旋构象：这是质粒DNA的天然状态，其中DNA链以紧密缠绕成一种螺旋形状。这种超螺旋构象有助于DNA在细胞内紧凑排列，便于复制、表达和传递。这种构象使DNA变得较为稳定。
开链构象：在某些情况下，质粒DNA可以变为开链构象，即DNA链的一部分或全部处于开放状态，不再紧密缠绕。这种构象常见于DNA复制、转录和修复过程中。DNA拓扑异构酶（topoisomerase）可在需要时引发开链构象，以允许DNA复制或转录发生。
环状构象：除了超螺旋和开链外，质粒DNA还可以形成环状构象。这种构象通常涉及DNA链的连接，形成闭合环状结构。环状质粒通常较小且在某些实验室应用中很有用，例如在分子克隆和质粒传递中。

Answer 2

我硕士专业是分子生物学这方面的，我可以很负责地告诉你，质粒DNA分子具有三种构型：共价闭合环开DNA（cccDNA,SC构型）、开环DNA（OC构型）和线性分子（L构型）。在细菌体内，质粒DNA是以负超螺旋构型存在的。在琼脂糖凝胶电泳中不同构型的的同一种质粒DNA,尽管分子量相同，但具有不同的电泳迁移率。其中跑在最前沿的是共价闭合DNA，其后依次是线性DNA和开环DNA,其原因是共价闭合的DNA其空间位阻最小，所以跑得最快。而开环DNA空间位阻最大，所以跑得最慢。
这些结论都是经得起实验考验的，我在做质粒的上有没有这个酶切位点鉴定的时候，我就会用原质粒和经过单酶切的质粒在同一块胶上进行电泳，看单酶切后的质粒是不是比原质粒跑得快从而鉴定出质粒有没有被切开。这个也分子生物学领域应用很广泛，PCR-RFLP方法就是基于这个原理进行限制性内切酶图谱方面的鉴定的。