如何鉴定提取质粒DNA的质量和含量
紫外分光光度计定量。
方法用大肠杆菌DH5α感受态细胞克隆丰量的pMD-18T重组质粒,紫外分光光度计定量后,根据重组质粒分子量计算其拷贝数,稀释成梯度浓度的荧光实时定量PCR的标准品,取1.0×106、1.0×104和1.0×102拷贝/μl高中低3个浓度的标准品,反复冻融1、6、11、15次和21次后,以冻融后的质粒标准品为模板同时进行real-time PCR扩增定量,比较量值变化。
高中值稳定,低浓度波动相对较大,高浓度质粒最大变化量为0.06个数量级;中浓度质粒最大变化量为0.18个数量级;低浓度质粒最大变化量为0.34个数量级。
扩展资料:
质粒DNA提取的要求规定:
1、以CaCl2沉淀法去除大分子RNA,Q-Sepharose和SOURCE两步离子交换层析法去除染色体DNA、小分子RNA、蛋白质等杂质。
2、有效去除质粒DNA制备过程中产生的杂质,可应用于药剂水平质粒DNA的制备。
3、L.P.Elwell的实验条件稍作改进,温和地制备清亮裂解液并抽提质粒DNA,应用Sephacryl S-1000作凝胶过滤,获得了纯度高、产量大,无染色体DNA。
参考资料来源:中国知网-反复冻融质粒标准品对荧光实时定量PCR实验的
2024-11-29 广告
用琼脂糖凝胶电泳鉴定质粒DNA。
琼脂糖凝胶电泳是分离鉴定和纯化DNA片段的常用方法。DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应,DNA分子在高于等电点的pH溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。
由于糖磷酸骨架在结构上的重复性质,相同数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因此它们能以同样的速度向正极方向移动。
不同浓度琼脂糖凝胶可以分离从200bp至50kb的DNA片段。在琼脂糖溶液中加入低浓度的溴化乙锭(ethidum bromide ,EB),在紫外光下可以检出 10ng的DNA条带,在电场中,pH8.0条件下,凝胶中带负电荷的DNA向阳极迁移。
扩展资料:
质粒DNA提取方法
1,碱裂解法
2,煮沸裂解
3,羟基磷灰石柱层析法
4,质粒DNA释放法
5,酸酚法等。
选择哪一种方法取决于以下几个因素
1,质粒的大小
2,大肠杆菌菌株
3,裂解后用于纯化的技术和实验要求
参考资料来源:百度百科-质粒DNA纯化
可以使用分光光度计,在260和280nm测吸光度,计算得到比较精确值