用python处理一个1G左右的数据集,运行速度非常慢,怎样优化?
给你几点个人的建议哈:
考虑拿C或C++重写.
考虑并行搞,找个hadoop集群,写成mapreduce程序跑 放在hadoop上跑,更多数据都不怕.
考虑升级机器,多搞点内存,然后东西尽量放在内存里搞.
考虑程序优化.
你得看看你程序慢在什么地方,可以按照以下步骤:
首先,确信你真的需要把全部数据过一遍。top一下,看CPU跑满了吗?单线程单进程实现?你能不能搞成多进程的?然后top看每个核都跑满了吗?没跑满的话,那你你要努力充分利用你的CPU,要让CPU跑满!看看程序,没跑满是因为IO吗?是的话IO能搞成异步的么?或IO次数太多?能不能减少IO次数?甚至只搞一次IO,比如你那1G的东西,能不能一次全搞到内存里,然后所有东西在内存里处理。
如果每个核心都跑满了,那就看看你的计算都花在什么地方,可以用hotshot等工具测一把. 可以粗略比较一下在 1/16 数据、1/8数据、1/4数据、1/2数据的情况下,hotshot的结果,看你的函数花的时间是怎么涨的.找出花时间最多的一个或几个东西,有针对性的优化,可以事半功倍.
找到问题所在之后,寻求解决方案. 如果是python带的数据结构不不合适,能不能用numpy之类的东西解决,能不能用一些数据库解决.能不能有的地方用cython包装一个C实现.
如果是算法不够好,能不能优化算法.
希望可以帮助到你哦,这只是我的一个建议哈!