Question

为什么线粒体会有自己的DNA?

它和细胞核的DNA有什么关系又有何差别？

Answer 1

这目前还没有定论
据说是因为早期单细胞生物，吞噬其他生物时，其DNA被一层膜包裹，生物逐渐进化就形成了如今的线粒体DNA

它和细胞核的DNA有什么关系又有何差别？
线粒体的DNA是单链环状的。而细胞核中DNA是双链的。
而且细胞核中的DNA是用来做遗传密码和合成蛋白质用的，而线粒体中的DNA是自己携带的与细胞核中的不同，线粒体有自己的一套遗传系统，能按照自己的DNA编码合成一些蛋白质。可以这样说，你自己身体中线粒体中的DNA是你的母亲直接遗传给你的，与细胞核中的无任何关系。
最后很明显的区别就是线粒体的DNA无蛋白质作为载体
即不存在染色体

Answer 2

这和线粒体的来源有关，有一种学说认为，线粒体是原始细菌进入细胞形成的，因此其中的DNA不同于核中的DNA（和组蛋白结合），而是游离的环状，行半自主遗传（所需蛋白质一部分需要自己DNA转录，另一部分由核DNA转录）

Answer 3

线粒体和叶绿体是半自主性细胞器，半自主性细胞器的概念：自身含有遗传表达系统(自主性)；但编码的遗传信息十分有限，其RNA转录、蛋白质翻译、自身构建和功能发挥等必须依赖核基因组编码的遗传信息(自主性有限)。
线粒体DNA呈双链环状，与细菌DNA相似。一个线粒体中可有一个或几个DNA分子。各种生物的线粒体DNA大小不一样，大多数动物细胞线粒体DNA的周长约为5μm，约含有16 000个碱基对，相对分子质量比核DNA分子小100～1 000倍。叶绿体DNA也呈双链环状，其大小差异较大(有200 000～2 500 000个碱基对)。叶绿体DNA的周长一般在40～60 μm。每个线粒体中平均约含有6个线粒体DNA分子，每个叶绿体中平均约含12个叶绿体DNA分子。

线粒体DNA和叶绿体DNA都可以自我复制，复制也是以半保留方式进行的。用3H嘧啶核苷标记证明，线粒体DNA复制的时间主要在细胞周期的S期及G2期，而且DNA先复制，随后线粒体分裂。叶绿体DNA复制的时间在G1期。它们的复制都受核的控制，复制所需的DNA聚合酶都是由核DNA编码，在细胞质核糖体上合成的。