长片段PCR 扩不出,可能的原因是什么

rosarabbit
2012-09-04 · TA获得超过1712个赞
知道小有建树答主
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具体是什么现象?是有短片段被扩增出来,还是就彻底没有看到任何条带?
通常如果片段长度很长,扩增失败有可能是因为超出了聚合酶的合成能力。所以也需要看你要扩增的片段,是否在你的扩增酶能力范围之内。如果片段特别长,建议使用长片段扩增酶。
另外,延伸时间是否充分。本来要合长片段就需要延伸时间足够长。建议根据长片段扩增酶的说明书进行PCR条件设定。
当然,最基本的是首先需要确定在样品中有目标片段,很多长片段扩增的时候,是预计有这么长,但实际样品中的情况不同。所以如果有扩增得到短的片段,也建议测序看看,扩增得到的是什么,再判断。
双眸含泪
2012-09-09 · 超过29用户采纳过TA的回答
知道答主
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长片段有时是引物不好扩,有时是GC含量的问题要换buffer,你要把楼上仁兄的那些情况先排除,保证一切正常再找原因。
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