Question

发现某个基因突变位点后，如何检测其对基因功能的影响？

如题，想知道如何确认基因突变对其功能的影响？急，多谢！

Answer 1

方法很多
如果这个基因表达蛋白的结构被解析出来的话
可以根据解析出的结构
分析突变是否在蛋白重要的功能位点
实验方法
克隆得到这个基因，
做定点突变得到你需要的突变基因
在细胞中表达
看蛋白在细胞定位有无变化
做coIP看和蛋白相互作用的蛋白有无变化
如果蛋白是个酶的话
看突变前后催化活性的变化
总之，看具体蛋白制定实验
最后最好做一个转基因的小鼠
把突变的基因转到小鼠中
看突变体和野生型的小鼠的不同

Answer 2

可以对比正常基因所编码的蛋白质检测变异后基因所合成的蛋白质的结构和功能。从以下几方面进行检测：

1.变异后蛋白质的氨基酸数量和种类是否发生改变；2.变异后蛋白质的结构（1-4）是否发生改变，3.变异后蛋白质的功能是否发生改变。前两者可以用放射性元素标记的氨基酸进行示踪检测，最后一条需要创设出一定的环境，用变异后的蛋白质与正常的蛋白质进行功能类比。

Answer 3

纯电脑方法~~不用去实验室做实验，也不用花钱~~

前提是，弄清楚这个基因的intron,exon, 是否有蛋白结构，他的具体作用是什么，作用的机理，和哪些蛋白，或者分子，结合，他所在的transduction pathway是什么

到pdb.org把这个蛋白找到
用ICMpro打开
把氨基酸序列改成突变后的序列
再用结构预测一下
再跟之前的结构吻合一下
看看结构上的变化是不是影响其功能
是否影响他和其他酶，分子，等的结合。

然后在ICMpro里作变异蛋白和其ligand(他酶，分子，等)的docking实验

最后看一下这个蛋白所在transduction pathway最终的产品是什么，再跟你之前的结构预测结合一下，就知道了。

Answer 4

一般来说是做对照实验，你可以参照营养缺陷型的对照实验：
正常的大肠杆菌可在不含氨基酸的培养基上生长，有某种突变的大肠杆菌可能不能合成某种氨基酸，而不能在基本培养生长。
将突变的大肠杆菌分别涂在只含有一种氨基酸的培养基上，大肠杆菌只能在某一个上生长，那个培养基上的氨基酸就是突变的大肠杆菌自身不能合成的，即由于基因的改变而导致的功能的改变，成为营养缺陷型