分离mRNA过程中,如果RNA有DNA污染会有影响吗 5
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会有影响。因为提取的RNA有DNA污染,那么反转录以后的cDNA也就有基因组DNA污染,这样,扩增cDNA。都会出现杂带或非特异性扩增,对实验结果不好。
由一个DNA分子,边解旋,边转录。利用细胞核内部的游离核糖核苷酸合成。合成规则遵循碱基互补配对原则。以上过程叫做转录,在细胞核中完成。
接着,mRNA穿过核孔。和细胞质中的核糖体结合。选择tRNA运输氨基酸,和对应的三个碱基排列好。再与其它的氨基酸通过肽键连接在一起,形成肽链。
扩展资料
RNA分子有三大类:信使RNA(mRNA),核糖体 RNA(rRNA)。
信使RNA的功能:把DNA模板链上的碱基序列转录为RNA分子上的碱基序列(mRNA),再从mRNA上的碱基序列通过合成蛋白质的机构获得氨基酸序列。
核糖体RNA功能:把翻译系统中各种组分聚集在一起,形成正确的空间排布及高级结构,以完成将遗传信息从mRNA到多肽链的转变。
研载生物科技(上海)有限公司_
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2018-06-26 · 试剂订购热线:400-968-6088
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有的.
你提取的RNA有DNA污染,那么反转录以后的cDNA也就有基因组DNA污染,这样,你扩增cDNA或者做qPCR,都会出现杂带或非特异性扩增,对实验结果不好.
所以一般吸取RNA上清液的时候,宁可浪费点RNA也不要混杂有下层的DNA.
你提取的RNA有DNA污染,那么反转录以后的cDNA也就有基因组DNA污染,这样,你扩增cDNA或者做qPCR,都会出现杂带或非特异性扩增,对实验结果不好.
所以一般吸取RNA上清液的时候,宁可浪费点RNA也不要混杂有下层的DNA.
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有的。
你提取的RNA有DNA污染,那么反转录以后的cDNA也就有基因组DNA污染,这样,你扩增cDNA或者做qPCR,都会出现杂带或非特异性扩增,对实验结果不好。
所以一般吸取RNA上清液的时候,宁可浪费点RNA也不要混杂有下层的DNA。
你提取的RNA有DNA污染,那么反转录以后的cDNA也就有基因组DNA污染,这样,你扩增cDNA或者做qPCR,都会出现杂带或非特异性扩增,对实验结果不好。
所以一般吸取RNA上清液的时候,宁可浪费点RNA也不要混杂有下层的DNA。
追问
谢谢你的回答,不过我用oligoT 先把mRNA分离出来在做反转,理论上说DNA应该会去除掉的吧
追答
oligoT是用来逆转录的,和mRNA没有什么关系吧……(可能是我孤陋寡闻,不太了解)
在逆转录的过程中,如果之前提的RNA中有DNA污染,是不会被去除的,会混在cDNA中。
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这要看你的实验要求。一般都会去除DNA污染。
我们都是用promega的RQ1(无RNase 活性的DNA 酶)处理。
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如果RNA中有DNA污染一定会对实验有一定的影响的。
1. 如果你扩增的基因有内含子,那么跨内含子设计引物可能不会有非特异扩增。但是如果DNA残留多的话会对PCR酶产生影响,扩增效率有收到抑制。
2. 如果你的基因没有内含子,那么有DNA扩增就会增强扩增信号(Real-Time信号会虚高,普通RT-PCR条带会比实际的亮),干扰到最终的分析结果。
3. 如果你的基因本身有内含子,而你没有特别设计引物,DNA残留稍微多一点那么你有可能会在Real-Time结果分析中看到溶解曲线有杂峰,或者在RT-PCR中出现非特异带。
建议你使用DNaseI处理步骤的试剂盒提取RNA,比如RNAprep系列(TIANGEN)的试剂盒或者使用TIANGEN的去基因组RT试剂盒FastQuant RT Kit(With gDNase),去基因组和RT总共只需要十几分钟。即使有非常严重的DNA污染都能去除的很干净,不会影响实验,而且价格和普通的RT试剂盒几乎一样很划算也很方便,你可以试试。
1. 如果你扩增的基因有内含子,那么跨内含子设计引物可能不会有非特异扩增。但是如果DNA残留多的话会对PCR酶产生影响,扩增效率有收到抑制。
2. 如果你的基因没有内含子,那么有DNA扩增就会增强扩增信号(Real-Time信号会虚高,普通RT-PCR条带会比实际的亮),干扰到最终的分析结果。
3. 如果你的基因本身有内含子,而你没有特别设计引物,DNA残留稍微多一点那么你有可能会在Real-Time结果分析中看到溶解曲线有杂峰,或者在RT-PCR中出现非特异带。
建议你使用DNaseI处理步骤的试剂盒提取RNA,比如RNAprep系列(TIANGEN)的试剂盒或者使用TIANGEN的去基因组RT试剂盒FastQuant RT Kit(With gDNase),去基因组和RT总共只需要十几分钟。即使有非常严重的DNA污染都能去除的很干净,不会影响实验,而且价格和普通的RT试剂盒几乎一样很划算也很方便,你可以试试。
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