Question

what you want和what do you want 这两句有什么区别?都对吗?

假如want后在加上to do呢

Answer 1

这二者是不同的。what you want只能用于从句里（通常是宾语从句）。例如：
May I know what you want?
what do you want (to do)?(你想要什么/做什么？）是一个特殊疑问句（单句）。

Answer 2

what you want不能独立成句，只能用于从句里。例如
I don't know what you want.
what do you want ?是一个正确的特殊疑问句。

追问

按句子成分来说应该可以单独成句的呀，是为什么呢？

追答

　没有助动词。也不行，不是句子不完整，而是特殊疑问句要求疑问词后面必须是一般疑问句语序。

Answer 3

你好！
有区别
what you want是做从句的
What do you want?是个独立的疑问句

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追问

按句子成分来说应该可以单独成句的呀，是为什么呢？

追答

呵呵，语序不同

追问

那就是两句对，只是语序问题么？我感觉是因为want及物，加上to do是不是就一样了？

追答

want sth
want to do sth
及物不及物都行啊
因为语序不同，从句用陈述语序