细菌鉴定中到底是16srDNA测序还是16srRNA测序?
细菌鉴定中测序测的是16S rDNA基因,因为RNA是不稳定的。
16S rDNA因其序列在物种间的高度多样性,成为细菌分类学研究的“分子钟”,素有“细菌化石”之称。
16S rDNA基因全长1542 bp,由9个可变区和10个保守区组成。其中保守区反映了生物物种间的亲缘关系,而可变区则表明物种间的差异,且变异程度与细菌的系统发育密切相关。
16srDNA测序包括细菌基因组DNA提取、16SrDNA特异引物PCR扩增、扩增产物纯化、DNA测序、序列比对等步骤。是一种快速获得细菌种属信息的方法。英文名称是16S ribosomal DNA identification,应用有细菌种属鉴定。
扩展资料:
在实验室中,主要是根据所用的鉴定仪器特点、感染性疾病的类型、标本种类、采集部位等因素建立具体的微生物学检验程序,大致步骤如下。
1、获得被鉴定菌种的纯培养菌落。
2、确定染色(革兰染色、抗酸染色)、形态和排列,按科、属、种依次鉴定下去。
3、运用知识、经验、最小数量的试验方法做出鉴定。
参考资料来源:百度百科-DNA测序
测的是16s rDNA序列,或者说是16s rRNA基因。即编码16SrRNA的DNA序列,所以说其实是16S rDNA测序,而且RNA还特别容易降解。
基因测序是测出DNA上的碱基是A,C,G,T中的哪一个;而基因检测是通过杂交或测序等方法来确定DNA序列中是否含有特定的一段序列,来明确相关的基因某些功能,比如耳聋基因检测就是用芯片来检测一个正常人是否携带隐性先天性耳聋基因或者药敏性耳聋基因。
测序只是得到DNA的序列,而检测是最终要跟功能建立联系。
扩展资料:
16S rDNA是细菌的系统分类研究中最有用的和最常用的分子钟,其种类少,含量大(约占细菌DNA含量的80%),分子大小适中,存在于所有的生物中,其进化具有良好的时钟性质,在结构与功能上具有高度的保守性,素有“细菌化石”之称。
在大多数原核生物中rDNA都具有多个拷贝,5S、16S、23S rDNA的拷贝数相同。16S rDNA由于大小适中,约1.5Kb左右,既能体现不同菌属之间的差异,又能利用测序技术较容易地得到其序列,故被细菌学家和分类学家接受。
参考资料来源;百度百科-16SrDNA