1、第一部主要讲一个隐藏了身份的刺客Desmond一觉醒来发现被人绑架到了一个秘密基地做实验，这伙人是一个叫Abstergo Industry的公司的人，而这个公司就是一直与刺客组织Assassin对立了几千年的圣殿骑士团的现代版本，他们为了通过提取Desmond的关于祖先Altair的记忆来找到先行者Those who came before，也就是所谓的造物主（嗯，西方宗教的观念嘛）的神器来统治人类的精神（在2中会有对这些神器的进一步解释）。在十字军东征时期的Altair是一个刺客大师，一开始桀骜不驯，冷漠自大，让组织陷入险境，受到师父惩罚从学徒做起去杀九个圣殿骑士，后来在任务中逐渐改变自己的态度，并发现了邪恶的师傅的阴谋（他们十个圣殿骑士共同发现了一个神器“禁果”，师父想独吞），最终杀死了师父。同时被绑架的Desmond也在现代通过提取记忆用的机器Animus的流血效应Bleeding effect获得了祖先的特技“鹰眼视觉”，发现了在他之前原来还有16个一样的受害者惨遭公司毒手，并且看到了给他做实验的博士和博士的女助手Lucy之间不同的立场（Lucy是同伴派的的卧底，博士是大反派），并决定逃出生天。
2、第二部开场就是Lucy帮助Desmond逃脱公司，并在同时破解了与他有着极大渊源的16号实验对象的记忆，于是将Desmond带回藏身处，开始继续让Desmond从16号指出的有关一个1479年文艺复兴时期的银行家子弟Ezio Auditore Da Firenze的身上提取记忆，于是有了2的剧情。Ezio的一开始只是个打群架，各种泡妞的纨绔子弟，但是不久后家人就被人陷害遭到灭门，只带着母亲妹妹逃到了叔叔所拥有的蒙泰利奇欧尼（英文忘了。。。）庄园里藏身，后来在叔叔的指导下发现自己的父亲是刺客组织大师Altair的后代，自己也是个天生注定的刺客，于是便以复仇为目的进行训练，一个一个手刃仇人，但是在斗争的过程中，Ezio复仇的欲望越发消逝，更多的是一种为人民服务的伟大精神（。。。）。在末段，Ezio了解并找到了“禁果”，而且被一直暗中帮助自己的刺客组织接纳为一员，更是发现自己的最大仇人竟然最后成为了教皇亚历山大六世。最后Ezio的禁果被夺走，他解开了刺客密函的谜题（密函由Altair撰写，在PSP刺客信条血缘里有叙述），找到了位于梵蒂冈的远古密室，在那里打败了教皇，并且发现了密室里的秘密，竟然是先行者留给500多年后的Desmond的信息（穿越了。。。）。与此同时，Desmond的藏身所被发现，通过流血效应获得了Ezio的身手的他击败警卫，再次与同伴开始逃亡。
《刺客信条兄弟会》（不能叫3，这个系列只有更换主角了才能更换数字）的开场是1499年，Ezio带着禁果与叔叔马里奥逃离梵蒂冈，但是在处理禁果时犹豫了，将禁果交给叔叔保管，同时Desmond一行人逃离追踪，躲在了500年后的马里奥的蒙泰利奇欧尼庄园里继续提取Ezio的记忆。此时的Ezio以为任务依然结束，可以享受生活，却被追来寻仇的教皇的儿子（同样是本作最大反派）Cesar Borgia，意大利当时最有势力的军阀（突然忘了说教皇叫Rodorigo Borgia 两人都历史上确有其人）带着军队毁了庄园。Ezio于是逃到罗马即教皇的老家开始组织起地下反抗组织--即刺客兄弟会，吸纳不服教皇重压统治的人入会共同抵抗教皇军队，并且通过好友们的帮助最终成为了刺客联盟的首领，在Cesar与其父争执而杀死了教皇亚历山大六世时趁机夺取了Cesar的禁果，最终将Cesar逼上绝路，在1507年Cesar率军攻取西班牙时与他决斗，并把他从城墙上扔了下去。最后他将禁果藏在了罗马的大圆形竞技场地下的密室中。得知了禁果位置的Desmond一行人出发解开了密室之谜，找到了禁果，而Desmond却被禁果控制杀死了Lucy，陷入了深度的Animus昏迷状态。
该游戏系列是以超高的自由度和精美的画面作为最大卖点的动作类游戏。玩家将在每部游戏中控制一名刺客，通过在任务中巧妙穿插重要的历史人物及历史事件带给玩家深沉的代入感。
《刺客信条》（Assassin's Creed）的故事设定在欧洲中古黑暗的第三次十字军东征时期，游戏舞台穿梭于大马士革、耶路撒冷等中东历史名城之间，当时的统治者以高压方式统治人民诛杀异己，百姓苦不堪言；
玩家扮演的是一位身怀绝艺的白衣刺客阿泰尔，以来无影去无踪的高超杀人技巧，专门刺杀残暴的统治阶层，而铲奸除恶也成为玩家信守的“刺客信条”，为救无辜百姓而努力。
刺客信条兄弟会的特色任务：
工会挑战：
在重建交际花、盗贼、佣兵总部后，解锁相应的工会挑战，招募第一个新手刺客后，解锁刺客工会挑战。其中刺客工会挑战最为简单，一般在主线任务进行中即可完成，奖励是解锁最强主武器阿泰尔之剑及刺客纹章。
交际花工会挑战完成后奖励玛利亚的匕首（二代中苏丹的短刀）和交际花工会纹章，佣兵奖励巴托罗缪的斧头及佣兵纹章，盗贼奖励拉·波尔佩的剑和盗贼纹章。用处都不是很大，重在精神。
刺客信条2：Desmond在刺客信条1之后本来是准备要处死的，但是Lucy帮他逃了出来，和另外两个现代刺客会合。为了找到伊甸园圣器的下落，Desmond不得不再次进入刺客兄弟会的机器Animus 2.0，这一次他成为了中世纪佛罗伦萨的贵族Ezio Auditore。Ezio的父亲和两个兄弟被陷害以后，他在自己的叔叔Mario Auditore的帮助下脱离险境，并且知道自己的家族是刺客家族。于是他开始自己的复仇之路。在复仇的过程中，Ezio慢慢知道了伊甸园圣器的事，并且自己也在慢慢成长，直到有一次圣殿骑士从外地运回威尼斯一件很重要的物品，被Ezio夺到，原来就是金苹果。于是Ezio发现一个事实，就是在罗马有一件伊甸园圣器“教皇权杖”，它和“金苹果”结合就能打开一些秘密。于是刺客们就前往罗马，一来为了杀死陷害Ezio一家的罗马教皇Rodrigo Borgia，二来为了抢夺教皇权杖。谁知Rodrigo早有准备，反刺伤了Ezio，抢了他的金苹果。但是Rodrigo没有刺客的血统，结合了教皇权杖和金苹果，但却无法激活。而后Ezio赶来，两人赤手空拳搏斗，Ezio最终胜利，但心一软没有杀死这位陷害自己一家的幕后主使。Rodrigo逃脱。Ezio身为正统刺客，发现自己的血统使两件伊甸园圣器合体激活，打开了罗马教堂地下的一间密室，而密室中出现的影像却是给后来人，也就是给现代正统刺客Desmond的信息。然而回到现代，正在此时，圣殿骑士出现，Lucy和Desmond不得不展开战斗，Desmond通过Animus的血统效应已经学会了Ezio的一些技能，击退了圣殿骑士以后逃离。
刺客信条兄弟会：Desmond和Lucy一行人一直逃到蒙特奥吉欧尼，也就是中世纪Ezio叔叔Mario的庄园。他们开始继续搜索金苹果的下落。回到Animus中，Ezio打败Rodrigo之后载誉归来，回到Mario的庄园，但不想第二天凌晨，Rodrigo的儿子Cesare Borgia带兵攻打庄园，并最终抢夺了金苹果，还杀死了Mario。Ezio也只能带伤逃离。逃离了以后，他孤身一人来到罗马，再次踏上了复仇之路。在Machiavelli、Da Vinci和罗马当地的佣兵、交际花和盗贼的帮助下，Ezio解放了罗马，拿回了金苹果，并最终杀死了Cesare。夺回金苹果后，Ezio把它埋在了罗马大剧场地下的一间密室里。回到现代，Desmond等人立即赶往罗马大剧场遗址，并进入密室，拿到了金苹果。但Desmond一碰到金苹果之后就被控制，不由自主走向Lucy，刺杀了她，随后陷入了昏迷。
刺客信条启示录：Desmond昏迷之后，其他刺客急忙将他放回了Animus，希望通过Animus能让他苏醒。在Animus中，Desmond的意识和肉体已经分离，他的意识遇见了另一位在Animus中游荡的“16号”意识，来自一位现代已经遇害的刺客。16号告诉他只有在Altair、Ezio和Desmond完全同步的时候才能让Desmond找回自我。于是Desmond第三次进入了Ezio的记忆。Ezio为了寻找古老刺客的知识，来到了Altair所在的马西亚夫城堡，发现一间Altair建造的密室。为了打开密室，Ezio必须找到五把Altair留下的钥匙，而这些钥匙已经被当时马可波罗的父亲带去君士坦丁堡埋藏。到了君士坦丁堡之后Ezio卷入了宫廷斗争，还认识了一位有魅力的女人Sofia。找到五个钥匙之后，Ezio和Sofia一起回到了马西亚夫城堡，打开了密室，见到了Altair的遗体和Altair留下的另一个力量更强大的金苹果。这时金苹果又被激活，Altair、Ezio和Desmond的意识完全同步，Desmond聆听了人类诞生前的文明留下的信息，需要Desmond拯救世界。在那之后，Ezio扔下了身上的武器，把它们和金苹果放在一起留在了密室，结束了自己的刺客生涯。回到现代，Desmond从Animus中苏醒了过来。
然后以上剧情，都是通过戴斯蒙用animus探索自己的祖先，也就是
刺客1里的 阿泰尔
刺客2 兄弟会 启示录 里的 ezio
刺客3里的 康纳
都是讲刺客与圣殿骑士之间的斗争（为了金苹果，最后朱诺说金苹果是被他们舍弃了的东西）。
刺客1没字幕，英语又没过6级。。。所以没玩。看剧情是讲本来大师级刺客阿泰尔违背了信条，被导师（贬为）新手去消灭圣地中一支由9个人组成的圣殿骑士的队伍。杀了各个圣殿首领之后，发现自己的导师其实也是圣殿骑士的一员，想独吞金苹果。最后阿泰尔杀了他
刺客2 兄弟会 启示录讲 纨绔子弟 ezio一家被陷害只有自己的母亲，妹妹和自己幸存。刺客2主要是复仇，最后发现自己是先知，就是能接受神明的指引的人。 兄弟会讲的也是复仇吧，叔叔被西泽尔杀害，ezio要重新组织兄弟会去反抗圣殿骑士。启示录主要是讲ezio探索阿泰尔留下的信息，跟伊甸园碎片有关（金苹果）。
刺客3 康纳是圣殿骑士海尔森和原著民（应该也是刺客）所生。他为保护自己的家园，受到神明的指引，寻找刺客兄弟会，接受训练，帮助华盛顿领导的独立战争，与英军抗衡，歼灭圣殿骑士。最终目的是自由吧。
差不多如此吧
