PCR技术是如何合成引物的?

jinrongyu613
2013-03-09 · TA获得超过2.2万个赞
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目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。亚磷酰胺三酯法合成DNA片段,具有高效、快速的偶联以及起始反应物比较稳定的特点。亚磷酰胺三酯法是将DNA固定在固相载体上完成DNA链的合成的,合成的方向是由待合成引物的3′端向5′端合成的,相邻的核苷酸通过3′→5′磷酸二酯键连接。

第一步是将预先连接在固相载体CPG上的活性基团被保护的核苷酸与三氯乙酸反应,脱去其5′-羟基的保护基团DMT,获得游离的5′-羟基。
第二步,合成DNA的原料,亚磷酰胺保护核苷酸单体,与活化剂四氮唑混合,得到核苷亚磷酸活化中间体,它的3′端被活化,5′-羟基仍然被DMT保护,与溶液中游离的5′-羟基发生缩合反应。
第三步,带帽(capping)反应,缩合反应中可能有极少数5′-羟基没有参加反应(少于2%),用乙酸酐和1-甲基咪唑终止其后继续发生反应,这种短片段可以在纯化时分离掉。
第四步,在氧化剂碘的作用下,亚磷酰形式转变为更稳定的磷酸三酯。
经过以上四个步骤,一个脱氧核苷酸被连接到固相载体的核苷酸上。再以三氯乙酸脱去它的5′-羟基上的保护基团DMT,重复以上步骤,直到所有要求合成的碱基被接上去。合成过程中可以观察TCA处理阶段的颜色判定合成效率。通过氨水高温处理,连接在CPG上的引物被切下来,通过OPC, PAGE等手段纯化引物,成品引物用C18浓缩,脱盐,沉淀。沉淀后的引物用水悬浮,测定OD260定量,根据定单要求分装。
关中落叶62
2013-03-10
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引物你自己设计,然后发给生物公司,过几天就合成好了。现在没有人自己合成引物了,很麻烦,而且要求也高。
别看那些Ctrl+C的人的回答了,我都服了这些人了。你回答的这么“专业”,你合成一个给我看看。当然,如果你是在生物公司专门合成引物的就当我没说。
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百度网友4d05352
2013-03-09
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在dna或cdna文库中找出目标基因的序列片段,在NCBI网站上搜索同源基因,挑选同源性高的序列与目标序列进行比对(可以使用DNAMAN软件),找出保守区;再用引物设计软件(primer5)或在线设计网站,通过设定参数进行引物设计~
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百度网友22f3490
2013-03-09 · TA获得超过3026个赞
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发给公司合。。。
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