Question

新一代测序中，基因从头测序和重测序有什么区别？我要做乙肝病毒DNA全长测序，应该选用哪种方法？

新一代测序中，基因从头测序和重测序有什么区别？我要做乙肝病毒DNA全长测序，应该选用哪种方法？为什么？谢谢！

Answer 1

1、条件不同

从头测序的条件是不依赖于任何物种基因组；重测序的条件是在已知物种基因组的情况下进行的。

2、病毒变异率不同

从头测序是通过拼接和组装的方式获得基因组序列图谱，病毒变异率很低；重测序可以寻找出大量的单核苷酸多态性位点，插入缺失位点，结构变异位点，拷贝数变异等变异信息，从而获得生物群体的遗传特征。病毒变异率很高。

乙肝病毒在医学上已经测过，只需要做重测序就可以。

扩展资料：

从头测序的原理是生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸，每组寡核苷酸都有固定的起点，但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。

可以区分长度仅差一个核苷酸的不同DNA分子的条件下，对各组寡核苷酸进行电泳分析，只要把几组寡核苷酸加样于测序凝胶中若干个相邻的泳道上。

全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序，并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。

SBC将不同梯度插入片段的测序文库结合短序列、双末端进行测序，帮助客户在全基因组水平上扫描并检测与重要性状相关的基因序列差异和结构变异，实现遗传进化分析及重要性状候选基因预测。

参考资料来源：百度百科-从头测序

百度百科-全基因组重测序

Answer 2

从头测序是目前为止还没有人测过那个物种的全基因组，没有参考序列进行比对，需要自己组装拼接后才能知道序列；而重测序是已经有人测过了，只需要重新测序，有参考序列了，只需要与参考序列比对。
乙肝病毒好像是已经测过的，只需要做重测序就可以！

Answer 3

专业性东西，自己看看这个资料：http://wenku.baidu.com/view/30fd9e8ba0116c175f0e4828.html

Answer 4

基因从头测序也叫做基因de novo测序，是指不依赖于任何已知基因组序列信息对某个物种的基因组进行测序，然后应用生物信息学手段对测序序列进行拼接和组装，最终获得该物种基因组序列图谱。
重测序是指在已知物种基因组的情况下，对物种内的不同个体或某个个体的不同组织进行基因组重测序，可以在全基因组水平上发现不同个体或组织细胞之间的差异。通过这种方法，可以寻找出大量的单核苷酸多态性位点（SNP），插入缺失位点（InDel，Insertion Deletion），结构变异位点（SV，Structure Variation），拷贝数变异（Copy Number Variation，CNV）等变异信息，从而获得生物群体的遗传特征。
病毒变异率很高，一般不用重测序，可以用de novo从头测序。