1、骨头不同
软骨鱼是不是硬骨构成骨骼的鱼类，称为软骨鱼。硬骨鱼骨骼中部分或者全部骨化成硬骨质。有骨质板状鳞片，头骨有接缝及行体外受精。硬骨鱼主要特征是具有至少一部分由真正的骨(与软骨对照而言)组成的骨骼。
2、特征不同
软骨鱼除侧线外，软骨鱼的吻部还有一种特殊的皮肤感受器-----罗伦氏壶腹。它是一个基部膨大的囊袋，可以探测水流、水压和水温，同时还是电感受器，能检测到低至0.01微伏的电压。硬骨鱼是水域中高度发展的脊椎动物，以其广泛的辐射适应分布于海洋、河流、湖泊各处。
3、分类不同
软骨鱼类一般分为板鳃类和全头类。板鳃类具板状鳃，头部两侧具鳃裂，无鳃盖，包括有已绝灭的裂口鲨目、侧棘鲨目和有现生代表的鲛目和鳐目。硬骨鱼类分化成走向不同进化道路两大分支：辐鳍鱼类（亚纲）与肉鳍鱼类（亚纲）。
4、分布范围不同
软骨鱼分布于低纬度海洋 ，个别栖息淡水 。硬骨鱼遍布淡水及海水水域，洞穴、深海、温泉中皆有其踪迹；各种外形与习性皆有硬骨鱼。
5、数量不同
硬骨鱼类身体的形状和生态适应类型也是千差万别，各有千秋。而且，硬骨鱼类无论是物种数量还是个体数量都远远超过许多其它脊椎动物的总和。因此，硬骨鱼类才是地球上真正的水域征服者。软骨鱼相对就数量少的多了。到中生代，软骨硬鳞鱼类便衰落了，仅少数属种残存至今。
参考资料来源：百度百科-软骨鱼
参考资料来源：百度百科-硬骨鱼
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软骨鱼的骨架由软骨组成，虽然脊椎有部分骨化，但是缺乏真正的骨骼。它们在海洋中是比较高等的动物，最早出现在泥盆纪，一直稳定发展到了现代。我们在水族馆中可以见到的鲨鱼、鳐鱼、魟鱼和银鲛，都属于软骨鱼。软骨鱼都没有鱼鳔，只能依靠不停地游动保持身体浮起来，保证从氧气丰富的海水中摄取氧气，如果停止游动，它就会沉入海底，海底的海水氧气含量低，难以维持生存。
↑鲨鱼是软骨鱼的一种
硬骨鱼是水中高度发展的脊椎动物，分布非常广泛，不论是海洋、河流、湖泊、洞穴，甚至温泉中，都能找到硬骨鱼的身影，是最常见的鱼。硬骨鱼也是所有生活在水中进化最成功的鱼类，现代脊椎动物一共5万中，其中硬骨鱼就有2万多种。我们平时吃的草鱼、鲫鱼、鲤鱼等等，都是硬骨鱼。硬骨鱼的主要特点就是骨骼的高度骨化（硬化成骨），甚至连鳞片也骨化了。另外，大部分硬骨鱼都有鱼鳔，可以通过鱼鳔的收缩来控制身体在水中的升降，在缺氧的环境中，鱼鳔还可以辅助呼吸。
↑硬骨鱼在生活中很常见
——以上内容参考米莱童书《生命简史》
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鲨鱼等由软骨而不是硬骨构成骨骼的鱼类，称为软骨鱼。软骨鱼大约有七百种，几乎全是生活在海水之中的食肉动物。软骨鱼有流线型的身体和成对的鳍。它们的表皮上布满盾状的鳞片，质地相当粗糙。由于它们为流线形，所以游泳速度极快。
鱼形动物中较高等的一类。体内骨骼全部由软骨组成，体外被盾鳞或无鳞。具奇鳍或偶鳍。体内受精，卵胎生或卵生，大多为海生种类。最早出现于泥盆纪，至石炭、二叠纪渐趋繁盛，一直稳定发展，直至现代。
软骨鱼类一般分为板鳃类和全头类。板鳃类具板状鳃，头部两侧具鳃裂，无鳃盖，包括有已绝灭的裂口鲨目、侧棘鲨目和有现生代表的鲛目和鳐目。全头类鳃裂外被一膜质鳃盖，海生，种类远少于板鳃类。
硬骨鱼
在泥盆纪中期，一些更为进步的硬骨鱼类出现了。它们骨骼中的一部分或者全部骨化成硬骨质。头骨的外层由数量很多的骨片衔接拼成一套复杂的图式，覆盖着头的顶部和侧面，并向后覆盖在鳃上。鳃弓由一系列以关节相连的骨链组成；整个鳃部又被一整块的骨片——鳃盖骨所覆盖。因此，它们在鳃盖骨的后部活动的边缘形成鳃的单个的水流出口。它们的喷水孔大为缩小，甚至消失。大多数硬骨鱼类由舌颌骨将颌骨与颅骨——舌接型的方式相关联。
这些硬骨鱼类的脊椎骨有一个线轴形的中心骨体，称为椎体；椎体互相关联，并连成一条支撑身体的能动的主干。椎体向上伸出棘刺，称为髓棘；尾部的椎体还向下伸出棘刺，称为脉棘。胸部椎体的两侧与肋骨相关联。
“额外的”鳍退化消失；所有功能性的鳍内部均有硬骨质的鳍条支撑。
体外覆盖的鳞片完全骨化。原始的硬骨鱼类的鳞较厚重，通常成菱形，可分为两种类型：一种是以早期肉鳍鱼类为代表的齿鳞，另一种是以早期辐鳍鱼类为代表的硬鳞。随着硬骨鱼类的进化发展，鳞片的厚度逐渐减薄，最后，进步的硬骨鱼类仅有一薄层的骨质鳞片。
原始的硬骨鱼类具有机能性的肺，但大多数后来的硬骨鱼类的肺转化成了有助于控制浮力的鳔。
1990年，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所的余小波研究员在云南曲靖西郊发现了斑鳞鱼，当时把它鉴定为是一种生活在4亿多年前泥盆纪早期的原始肉鳍鱼类。肉鳍鱼类是硬骨鱼类大家族中的一支，硬骨鱼类的另一支是辐鳍鱼类。
斑鳞鱼的进化位置
1999年4月，中科院古脊椎所的朱敏研究员通过对斑鳞鱼进一步研究发现，斑鳞鱼不仅可能是最原始的肉鳍鱼类，而且可能是整个硬骨鱼类最原始的代表。斑鳞鱼中保留的许多非硬骨鱼类特征填补了硬骨鱼类和非硬骨鱼类之间形态上的缺环。
泥盆纪中期，硬骨鱼类分化成走向不同进化道路的两大分支：辐鳍鱼类（亚纲）和肉鳍鱼类（亚纲）。
从总体上说，地球上所有生活在水里的动物没有任何一类取得了像硬骨鱼类这样的进化成功。即使是那些高度发展了的最完全的水生无脊椎动物，例如各种各样的软体动物以及中生代期间发展地很复杂的菊石类，也远远达不到硬骨鱼类对水生生活的那种适应程度。硬骨鱼类已经占据了地球上所有水域中的各种生态位，从小的溪流到大的河流、从大陆深处的小小池塘到各类湖泊、从浅浅的海湾到浩瀚大洋中各种深度的水域，到处都有硬骨鱼类在漫游。硬骨鱼类各个物种之间体形大小上的差别也很悬殊，有些小鱼永远长不到1厘米以上，而鲔鱼可以长得非常巨大。硬骨鱼类身体的形状和生态适应类型也是千差万别，各有千秋。而且，硬骨鱼类无论是物种数量还是个体数量都远远超过许多其它脊椎动物的总和。因此，硬骨鱼类才是地球上真正的水域征服者。
