请问如何用perl统计一个字符串里面特定字符的个数?
比如说有一个文件,每一行都是类似于以下的字符串(其实是DNA序列)TCTCATGTGAAAAACTATATCAATAATATAAAAACATTGCTGGCTCCGGTGC...
比如说有一个文件,每一行都是类似于以下的字符串(其实是DNA序列)TCTCATGTGAAAAACTATATCAATAATATAAAAACATTGCTGGCTCCGGTGCGCTTGTGACGGCCCGTGGAATGTTCAATCGTCTTGAATGCAAAAATTGTTTTATTAACATGNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN用perl处理的时候先打开文件,然后while() 但是这样每次$_得到的都是整个一行的字符,也就是第一次 $_='TCTCATGTGAAAAACTATATCAATAATATAAAAACA'我想要统计其中某个特定字符的个数(比如G的个数),想用shift,pop,但是变量类型不对我刚开始学perl,请教各位应该怎么做?谢谢!
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3个回答
推荐于2017-11-25
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参见perl正则表达式的理论,匹配的结果为布尔型,替换的结果为数值型(成功的话),就可以得到这个问题的解决办法:my $var = 'TCTCATGTGAAAAACTATATCAATAATATAAAAACA';my $count = ($var =~ s/A/#/g);print $count;进一步扩展这种用法,将你需要统计的字符替换为一个不出现在字符串中的字符,比如#,就可以在整个文件中统计出你需要统计的字符的数量.就是2楼的答案,但2楼统计的结果是不分大小写的,如果区分大小写,就 去掉i即可:my $count = ($var =~ s/A/#/g);
2013-06-07
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#!/usr/bin/perluse strict;use warnings;open IN,"dna.txt" or die "Cannot open dna.txt:$!";my $sum;my @line;while () { push @line, $_=~ /T/gi;}print 'T的总数共有:'.scalar @line;
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2013-06-07
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本来想说个哈希 算了ls说了好多、、、、、、、
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