求助,加尾法检测miRNA引物如何设计
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上海宇玫博生物科技有限公司
2023-08-27
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miRNA引物设计(茎环法+染料法检测)
设计方法:通用茎环后端加miRNA后面6个碱基的反向互补序列为反转录引物,正向引物为miRNA去除后面6个碱基的序列,反向引物在茎环上。
反转录茎环通用序列:
GTCGTATCCAGTGCGTGTCGTGGAGTCGGCAATTGCACTGGATACGAC
miRNA序列:
>mmu-miR-99b-5p
MIMAT Mus musculus miR-99b-5p
CACCCGUAGAACCGACCUUGCG
mmu-miR-99b-5p反转录颈环引物为:
GTCGTATCCAGTGCGTGTCGTGGAGTCGGCAATTGCACTGGATACGACCGCAAG
定量PCR反向引物为:TGTCGTGGAGTCGGC
正向引物为:CACCCGTAGAACCGAC
设计方法:通用茎环后端加miRNA后面6个碱基的反向互补序列为反转录引物,正向引物为miRNA去除后面6个碱基的序列,反向引物在茎环上。
反转录茎环通用序列:
GTCGTATCCAGTGCGTGTCGTGGAGTCGGCAATTGCACTGGATACGAC
miRNA序列:
>mmu-miR-99b-5p
MIMAT Mus musculus miR-99b-5p
CACCCGUAGAACCGACCUUGCG
mmu-miR-99b-5p反转录颈环引物为:
GTCGTATCCAGTGCGTGTCGTGGAGTCGGCAATTGCACTGGATACGACCGCAAG
定量PCR反向引物为:TGTCGTGGAGTCGGC
正向引物为:CACCCGTAGAACCGAC
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