清朝的时候福建南少林寺是怎么毁灭的？
清代乾隆年间，泉州少林寺第三次被焚毁，起因是“胡惠乾事件”。
清兵入关，大肆血腥屠杀，强迫汉人剃头扎辫子，加深了民族矛盾，一时各地汉人反清复明的情绪高涨，在民间秘密联络，组织各种力量对抗清廷。
“胡惠乾事件”波及广东、福建两省，而泉州又是郑成功的故乡，反清复明意识颇具群众基础。乾隆帝觉察到其严重性，认为泉州少林寺的存在对清朝统治不利，担心南少林武僧与郑成功的余党相勾结，终于作出毁寺的铁腕决定。
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南少林寺的三兴三废
第一次：建于唐龙朔，废于天佑
清蔡永蒹《西山杂志》转引唐《闽中记》云：唐龙朔（唐高宗李治（628－683））元年（661年）以前，“智空入闽中，建少林寺于清源山麓，凡十三落。”“少林寺十三进，周墙三丈，陇田百顷，树林茂郁。”
智空（字道广）是救唐王闻名的嵩山少林寺十三棍僧之一，其入闽，开创了闽武僧之先河。共传十二门徒，有力能擒虎、善挟千斤之鼎者，有能执千斤之弩、能舞百节链锤、飞行迅速者。
南宋施梦说《东鲁诗集》说：“少林寺宇筑清源，十进山门万丈垣；百亩田圆三岭地，千僧技击反王藩。” “王藩”即指闽王王审知。王审知毁掉泉州南少林寺，是南少林寺的第一次被毁。
第二次：建于宋太平兴国，废于至元
《西山杂志》载，北宋宋太宗（976-983）太平兴国六年（981年）诏修泉州南少林寺。此为泉州南少林寺的第二次兴起。
北宋文献记载，少林寺有山门、大雄宝殿、法堂、达摩祖师堂、十三堂、罗汉堂、玄女堂、藏经阁、天王殿、观音殿、地藏殿及其他配套设施，占地400亩。
2002年复建天王殿时，从地下挖掘出石制寺庙构件40多件，其中塔座1个、塔盖1个、与承天寺应庚塔相似的塔刹7个、石帽4个、柱础4块、石柱6根等，保存完整的直径达1米的榫石就有20块，体现出当时寺庙建筑的宏大规模。火烧过的斑驳痕迹似乎诉说着一段武林传奇。专家推测，这些构件极有可能是唐宋时期泉州少林寺的建筑构件。唐、宋鼎盛时期，寺内曾住有武僧数千人。
《西山杂志·统志》载：“宋景炎元年（宋端宗赵昰年号）（元至元十三年，1276年），清源少林寺千僧反蒲寿庚之降元……（元兵）追至少林寺……刀光剑影，以一当十，元兵尸横清源城东，枕骸遍野。唆都至，发矢，千僧毙焉，存者百人……亡入德化（戴云寺）。”此为泉州南少林寺第二次被毁。
第三次：建于明洪武，废于乾隆二十八年
《西山杂志》：明洪武十年（1377年），玄妙观法本（宋末千僧抗元之后逃至德化的少林寺僧人，高龄135岁）劝募州官黄中立“疏奏朝廷，敕修少林寺。”僧人传技击于泉南。此为泉州南少林寺的第三次兴起。
清道光《晋江县志·卷69》载：“镇国东禅寺在仁风外东湖畔……明宣德十年（1435年）重修，后废。僧人修其旧址十分之一，兼祀知县彭国光，以彭曾为僧复寺田也”。
嵩山少林寺德虔法师《少林武僧志》（北京体院出版社，1988年）称：“《少林寺内传》载，垣然和尚武功超群，受到（明）嘉靖皇帝的嘉奖。当年垣然和尚的高足月空法师曾受命带领30多个打出山门的武僧，到福建泉州抵抗倭寇立功，并在那里建立一座南少林寺，做了该寺的方丈。”时至今日，闽南仍流传着北少林武僧平倭的故事。
清乾隆年间，乾隆下令毁寺，部分寺僧避于南安一片寺。此为泉州南少林寺第三次被毁。火烧少林寺之后，少林寺和尚至善法师避祸民间，继续招收少林弟子，反清复明。至善、洪熙官及其弟子传至广东，继续发展南少林拳，出了南少林拳王黄飞鸿,后又由黄飞鸿弟子传至香港，并远播美国等。
现代重建
1992年10月在原址重建，至1997年成大雄宝殿、五观堂及僧舍。2002年开始在大雄宝殿正前方复建天王殿。此为泉州南少林寺的第四次重建。
南少林寺即泉州少林寺，全称镇国东禅寺，俗称南少林；是相对于河南的少林寺而言。位于泉州清源山东麓，相传是曾救唐王的十三棍僧之一的智空入闽所建，是中国南方少林武术的发源地。
早年的泉州南少林寺建筑众多、地界庞大；东至东岳山麓，西至东门护城河，南至东湖，北至伊斯兰墓地。现存的东禅少林寺仅是宋时期泉州南少林寺的一小部分。
重修的泉州少林寺是根据北宋文献的记载而复建，有牌坊、正山门、南山门、天王殿、大雄宝殿、方丈楼、演武堂、观音阁、藏经阁、钟鼓楼、五观堂等。
大雄宝殿是泉州少林寺主体工程，大殿雄伟壮观，堪称建筑精品。正面四个金碧辉煌的大字“少林禅寺”乃中国佛教协会原会长赵朴初先生亲笔题写；“大雄宝殿”匾额由泉州市周焜民副市长题写，字迹苍劲有力。
参考资料来源：百度百科--泉州南少林寺
《会薄》中记录了天地会创立的一段悲壮历史，这就是著名的“西鲁故事"。
康熙十三年，西鲁国入侵国境，朝臣官兵抵挡不住，朝廷张贴皇榜招募天下勇士，许诺退兵者封侯赐爵。南少林寺僧自愿揭榜请缨，奋勇杀敌卫国。不料得胜回朝后，康熙却火烧少林寺，屠杀僧人，侥幸逃脱的五个和尚歃血盟誓“反清复明”，组织天地会，为死难者报仇。
1990年4月3日，几位专家来到北少林，拜访寺中的方丈德禅大师。
德禅大师听了几位专家们的来意后，当即找来寺中的高僧一起座谈。高僧告诉专家，如果想从碑林、碑廊中找到有关南少林寺的文字根据，在清朝以前那是很多，但在清康熙以后就不可能找到了。
原来，康熙皇帝因害怕北少林参与反清复明的活动，在血腥镇压南少林的同时，对北少林也发出了解散僧兵、不准练武、不准同南少林有任何来往的敕令。而且把有关的碑碣全部打毁，文字全部烧掉。
