因为神明给佐为在人间的时间已经到了，所以离开了光。
在最后，佐为棋高一着，以半目之差取胜，佐为释然的同时，也深深感谢全力以赴的行洋。对局结束之后，从头至尾在一旁观棋的光却突然点出棋局末尾能够令塔矢行洋反败为胜的一步棋。因为佐为领悟到，神明让他在人间滞留的千年时光马上就到了，就是为了让光看到这一局棋。
就在这局之后，佐为开始发觉自己一直停滞的时间开始流动。作为印证，光发现佐为附身的棋盘上血迹变淡了。佐为预知到他很快就要消失，并屡屡表现出焦虑。她希望能在自己尚在人间的日子里尽量多跟光下棋，但光并未放在心上，反而认为佐为在杞人忧天。
在一个风和日丽的男孩节（2001年5月5日），在佐为近乎任性的要求下，累极了的光勉强同意跟她下棋。就在这局对弈中，时间到了，然后佐为在光打盹的空隙消失了。
扩展资料：
剧情在68集、69集、70集分别有讲——
第68集 不战而败
剧情简介：光一直没有参加职业赛，不只是和谷等棋院的朋友连学校的同学也很担心他的情况。光当然不能对他们说出自己不想再下棋的理由，是因为如果自己再下棋，佐为就不会再回来。然而在光的心灵深处似乎还是对围棋难以忘情。
第69集 意志坚定的访客
剧情简介：光突然不再出现在任何的比赛中，让所有人都很惊讶，特别是看好他的绪方老师以及桑原老师。不过桑原老师似乎有把握他一定会再回到棋坛，因为他相信进藤光与塔矢亮是命中注定的劲敌，而伊角的回国则扭转了整个情势。
第70集 原来佐为在这里…
剧情简介：在伊角诚挚的要求下，光终于答应为了帮助伊角再下一局棋，没想到光却因此在他自己下的棋盤上发现了佐为的存在。光寻寻觅觅的佐为原来一直就在棋盤上，这让光明白想要再见到佐为必须一直下棋。
《棋魂》的结局让人无奈，佐的消失算不算一个败笔？《棋魂》中最让伤心的一幕莫过于佐的消失。而为他的离去徒添悲伤的是，背景乐的哀婉与台词的契合简直会让人崩溃。尤其是年龄小一些的时候看，就仿佛跟主角小光一样亲身经历了这种离散的悲痛。那么问题来了，佐的消失算不算一个败笔？小编认为非但不是，相反，这其实是个神来之笔。为啥呢？且听小编慢慢道来：
佐的那一句“神明是为了让小光看到这一局才延续了我千年的光阴”，解释得不能再充分了。还感觉不能理解的话再琢磨琢磨佐的那句：“人是为了另外的某个人而存在的。如果虎次郎是为我而生的话，我是为小光而生吧。而小光肯定也是为了什么人而存在。就这样千年连着又一个千年直到神之一手。”一切命运流转，一切命中注定，人与人的一局又一局，只为时光的终点，——只为了领悟到神乎其技的那一刻。
漫画后续也借高永夏之口更展开了这一主题，“为了连接过去与未来？我们都是如此。”不光是围棋，人类所有文明的历程皆是如此——为了未来的某一刻，由现在连续过去和未来，佐为的消失就是交接棒的传递他已经种下了未来的种子，使命已尽，是时候归于时光流动，回归于终焉。而佐的消失之所以如此令人心碎，除如此让人难以释怀，除了佐人见人爱的角色魅力以外，还是要佩服堀田老师高超的心理描写。
当意识到自己又回归于残酷的时间流动之时，看着棋艺仍旧不可能企及自己分毫的小光，佐心里一片妒火没错，小光明明还下不过自己，为什么神却选择了小光，没有选择自己？拥有时间，拥有未来，拥有实体的小光是如此让人羡慕，还想要继续下棋，想要永远永远下下去。而且最重要的是不想和小光分别，还想要继续和小光在一起，所以佐最后一句话是“小光，和你在一起的日子我很高兴”。没错，佐在最后一刻最心痛的并不是消失，并不是再也无法追求神之一手，而是和最好的朋友永远的分别。
记得小光说过什么吗？他下棋是“为了远古的过去和遥远的未来承上启下，所以我存在，我们大家存在。”，围棋就是这样一代代传下去的。佐为，作为一个深深热爱围棋的人，他下棋不仅仅是为了自己想下，更要将围棋延续给下一代，他做到了，他让小光踏上了职业棋手之路，给后人留下了这么多棋谱，他也下了近40年的围棋。
一千年前，是佐为选择了死，这就是代价。若他活着，他将无法下棋，也无法生存，所以他死了，付出了生命的代价，相对的，神给了他一千年，让他再下围棋，让他遇见光和虎次郎，让他可以一心一意地下围棋。
真的，佐为很幸福！不是每个人都可以这样追逐自己的梦想的！
佐为在这一千年，什么都不用顾虑，只要追逐自己的梦想，这不是很好吗？如果是我，我也会愿意！
所以，这一千年是神的恩赐！
但是恩赐不会长久，等到他的代价得到了补偿，他就消失了，但是他不会有遗憾了，作为一个棋手，他该做的东西都做完了。
天下没有不散的宴席，佐为走的时候，是笑的，他很幸福！
另一方面，就是商业漫画的结果……佐为走这么凄惨，赚足了大家的眼泪，也给大家留下了这样一个“残缺才是完美”的结局。
一句话：佐为冤死，读者哭死，作者赚死……
SO，不要难过，佐为是幸福的！
这个回答再次复制。。郁闷ING
觉得对不起楼主ING
楼主，你要记得，世界上的万物都是一代代传下去的，我们现在的一切都是远古时留下的，我们再留给下一代。
佐为，我们，一切的一切，都是这个接替过程中的东西。
~~可爱的佐为因为秀策的死而愧疚了很久，遇见进藤光之后，小光的技飞长，佐为也渐渐领悟神之一技，但是佐为选择了离开，其中有一个原因也是佐为不想看到小光像秀策一样倒在棋盘上。伟大的佐为也因为向小光传授了棋魂的精髓而不必作为幽灵出现成为了小光心中永远棋神。
*题外话：在日本的围棋史上曾经有一位棋力超强的人叫本因坊秀策。故事的设定因为有真实的宗师可寻和精彩的围棋推广番外，这部动画片曾经在日本轩起一场热烈的围棋风。
