南通大学有4个校区,分别是主校区、启东校区、启秀校区和钟秀校区。1、主校区，南通市崇川区啬园路9号，有文学院、理学院、商学院、外国语学院、机械工程学院、电子信息学院、电气工程学院、
计算机科学与技术学院、建筑工程学院、纺织服装学院。
2、启东校区，江苏省南通市
启东市西振海路111号，有公共卫生学院、地理科学学院、理学院、法政与管理学院。
3、启秀校区，江苏省南通市崇川区启秀路19号，有护理学院、医学院。
4、钟秀校区，南通市外环东路999号，有教育科学学院、生命科学学院、体育科学学院、地理科学学院、艺术学院。
