农村合作医疗在外地就医门诊费不能报销，住院费用要在户籍地报销，外地不能报销。
就报销而言，农村合作医疗参保者大部分的费用都是门诊费用，在居住地不能报销，拿回户籍地还是得不到报销，即便是住院费用，回到户籍地可以报销但也存在办理报销的程序繁琐，来回成本太高的问题。
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扩展资料：
根据国家药品价格谈判工作有关要求，做好国家谈判药品与新型农村合作医疗报销政策衔接有关工作。积极行动，根据国家药品价格谈判结果及时调整新农合报销药物目录。尚未调整的省份，要结合当地经济发展、新农合筹资水平、医疗服务能力、地方疾病谱变化等实际情况。
在执行谈判价格的基础上，力争在2016年10月底前将国家谈判药品纳入新农合报销药物目录，并报国家卫生计生委基层司备案。基金支出压力较大的地区，可选择部分品种或从大病保险做起。
参考资料来源：
/baike.baidu.com/item/%E6%96%B0%E5%9E%8B%E5%86%9C%E6%9D%91%E5%90%88%E4%BD%9C%E5%8C%BB%E7%96%97?fromtitle=%E5%86%9C%E6%9D%91%E5%90%88%E4%BD%9C%E5%8C%BB%E7%96%97&fromid=7475655"target="_blank"title="只支持选中一个链接时生效">百度百科——新型农村合作医疗
/www.gov.cn/zhuanti/2015-06/13/content_2879014.htm"target="_blank"title="只支持选中一个链接时生效">中国政府网——国务院办公厅转发卫生部等部门关于建立新型农村合作医疗制度意见的通知（国办发〔2003〕3号）
一般情况下根据各个省市县的不同，报销比例优惠有所差异，但是通常不转院的（当地就医）报销25%，转院的报销45%。
报销时需带上诊断证明书、出院记录和新农合证、医疗费用发票、医疗卡、身份证(或户口簿)到交新农合所在地卫生院审核报销。 有的地方需要开具转诊证明才能报销，所以得在入院期间去办理转诊证明，否则出院以后转诊证明是不让办的。不过每个地方的规定不同，详情可以咨询当地的社保部门。
新农村合作医疗保险是以区县为统筹单位的，异地就医报销政策，包括可报销医院、报销比例等，都由各个区县的新农合办公室规划制定；各地要求有差异，农民异地就医前一定要事前咨询所在县区新农合办公室。
不同就医形式的报销方法：
比如在定点医疗机构治不了的病人，可以向上级医院提出转诊，到新农合办公室审批后，可以到市级新农合定点医疗机构、省级定点医疗机构就医；
这种就不需要转诊证明了，只需出院后携带病历和外出证明就可以按转诊报销；
可以办理相关手续，将医疗关系转至外地，这样，如果在外地就医，可以回当地按转诊报销。
