我认为我们先注意一下灰原说过的一句话“工藤，你还不知道吧，组织跟半世纪前的计划就有关系”。这句话意味着该组织的历史非常长。从时间上推算，灰原说这句话大概在1995-1996年左右（按照柯南世界的时间）。往前倒推50年，刚好就是1945-1946年，这个时期刚刚好是二战结束日本战败的一年以内。
黑衣组织目前的活动范围从目前的事件看来主要在日本，另外在美国也有一定量的涉足。把实验室建在东京也能说明他们活动的区域和范围。
黑衣组织每个人的身手都不错，比较有代表性的就是琴酒和贝尔莫。大家还记得《往天国的倒数计时》中琴酒拿着狙击步枪准备狙击sherry-雪莉（其实是被被误认成宫野志保的铃木园子）]的镜头吗？，类似的场景在柯南中并不少见到。这就能说明黑衣组织的正式成员都是训练有素的。问题来了，
他们到底在哪里完成这些只有军队和情报部门才有的专业性极强训练的呢？另外并没有迹象显示他们与恐怖主义有关，与其说是恐怖主义还不如说是为了达到特定目的所作的必要工作。
事件方面，先看看至今为止排除掉跟宫野志保（灰原哀）有关的事件并判明肯定于组织相关的事件，（1卷）以走私枪支的证据照片勒索1亿元、（2卷）使用人质唆使抢劫10亿元、并射杀犯人、强行夺取赃款
、（4卷）通过贩卖情报获得4亿元。企图爆炸交易对方、湮灭证据、（12卷）与电玩公司职员买卖程式。为湮灭证据引爆了大厦内的饮食店、（24卷）组织一成员（汽车公司社长）制造事故杀害任务失败的另一组织成员（政治家）。排除掉为了资金和杀掉知情人。就只剩下程式的内容了。关于aptx4869。可以认为只是黑衣组织为了行动更方便而研究出来的毒药，从第一集开始就很明显。新一和志保因为它而变小完全是意外。我们再来看看其它的线索。《人鱼失踪记》时间中名册里出现了宫野志保的名字，虽然看起来像是偶然在哪里求签，但是注意宫野志保（灰原哀）是长期处于黑衣组织控制之下，而且在英国留学后来就开始为黑衣组织研究化学药品。并且君惠（事件人物）的母亲是被火烧死的，如果几个人只是想试试看是不是真的有长生不老才放火我们本身也无从查证，但是不能排除宫野志保就是到那里去调查长生不老药的…然后黑衣组织用了掩人耳目的方法杀死了君惠的母亲…再结合贝尔莫的容貌之疑问。更能体现出这个问题。
