两者之间没有区别。
海关编码即HS编码，为编码协调制度的简称。其全称为《商品名称及编码协调制度的国际公约》，简称协调制度（Harmonized System，缩写为HS）。
HS编码“协调”涵盖了《海关合作理事会税则商品分类目录》（CCCN）和联合国的《国际贸易标准分类》（SITC）两大分类编码体系，是系统的、多用途的国际贸易商品分类体系。
除了用于海关税则和贸易统计外，对运输商品的计费、统计、计算机数据传递、国际贸易单证简化以及普遍优惠制税号的利用等方面，都提供了一套可使用的国际贸易商品分类体系。
扩展资料：
HS编码（海关编码）的内容：
HS采用六位数编码，把全部国际贸易商品分为22类，98章。章以下再分为目和子目。商品编码第一、二位数码代表“章”，第三、四位数码代表“目”（Heading），第五、六位数码代表“子目”（Subheading）。
前6位数是HS国际标准编码，HS有1241个四位数的税目，5113个六位数子目。有的国家根据本国的实际，已分出第七、八、九位数码。在HS中，“类”基本上是按经济部门划分的，如食品、饮料和烟酒在第四类，化学工业及其相关工业产品在第六，纺织原料及制品在第十一类，机电设备在第十六类。
运输设备在第十七类，武器、弹药在第十九类等。HS“章”分类基本采取两种办法，一种是按商品原材料的属性分类，相同原料的产品一般归入同一章。章内按产品的加工程度从原料到成品顺序排列。
另一种是按商品的用途或性能分类。制造业的许多产品很难按其原料分类，尤其是可用多种材料制作的产品或由混合材料制成的产品及机电仪产品等。
HS按其功能或用途分为不同的章，而不考虑其使用何种原料，章内再按原料或加工程序排列出目或子目。HS的各章均列有一个起“兜底”作用，名为“其他”的子目，使任何进出口商品都能在这个分类体系中找到自己适当的位置。我国目前使用的HS编码，一共10位，其中前面8位称为主码，后两位称为附加码。
参考资料来源：百度百科-HS编码
参考资料来源：百度百科-商品名称及编码协调制度的国际公约
一、制定的主体不同
1、HS编码由世界海关组织主持制定的一部供海关、统计、进出口管理及与国际贸易有关各方共同使用的商品分类编码体系。
2、海关编号由各海关在接受申报环节确定，应标识在报关单的每一联上。
二、位数不同
1、HS编码采用六位编码，适用于税则、统计、生产、运输、贸易管制、检验检疫等多方面。
2、海关编号为9位数码，其中1－2位为接受申报海关的编号（《关区代码表》中相应海关代码的后2位），第3位为海关接受申报公历年份4位数字的最后1位，后6位为顺序编号。
三、使用范围不同
1、HS只是指导、协调性的，所以叫HARMONIZATION SYSTEM；
2、海关编码是海关管理实际进出口操作用的。但是在实际操作中，各国海关又是以HS为基础，并依照WCO的相关原则确定各自的海关编码。
参考资料来源：百度百科——HS编码
参考资料来源：百度百科——海关编号
(2)位数不同。HS只有6位；海关编码则各异，我国是10位。
(3)使用范围不同。HS只是指导、协调性的，所以叫HARMONIZATION SYSTEM；而海关编码是海关管理实际进出口操作用的。但是在实际操作中，各国海关又是以HS为基础，并依照WCO的相关原则确定各自的海关编码。所以，在一定范围内，尤其在绝大多数操作中，都是把两者等同称呼。
