1.高度重复序列
重复几百万次，一般是少于10个核苷酸残基组成的短片段。如异染色质上的卫星DNA。它们是不翻译的片段。
2.中度重复序列
重复次数为几十次到几千次。如rRNA基因、tRNA基因和某些蛋白质（如组蛋白、
肌动蛋白、角蛋白等）的基因。
3.单一序列
在整个
基因组中只出现一次或少数几次的序列（也称为单拷贝序列或单拷贝基因），在小鼠中约占基因组的70%。如珠蛋白基因、卵清蛋白基因、丝心蛋白基因等。实验证明，所有
真核生物染色体可能均含重复序列而
原核生物一般只含单一序列。高度和中度重复序列的含量随真核生物物种的不同而变化。
