1、《名侦探柯南：世纪末的魔术师》
《名侦探柯南：世纪末的魔术师》是日本东宝公司于1999年4月17日出品的一部动画电影。该片是《名侦探柯南剧场版》的第三部。由儿玉兼嗣、联合执导。高山南、山崎和佳奈、神谷明等人担任主要配音。
剧情简介
罗曼诺夫王朝的皇室秘宝－回忆彩蛋，将在大阪铃木财团美术馆内展出的同时，怪盗基德寄出“犯案预告信”准备夺取这无价的皇家艺术之宝，于是铃木会长要求小五郎协助警方侦查，以防彩蛋被窃取。柯南一行人来到大阪，遇到服部平次，便一同侦查此案。
在美术馆遇到了苏联大使馆的书记、珠宝美术商、罗马王朝研究家、职业摄影师等人。看完彩蛋，大家便解读预告信线索，不料将时间、地点都解读错误。而基德窃听到彩蛋被转移了。在疏於防备的情况下，基德成功地找到了回忆彩蛋。
虽然柯南已经发现了基德的行动，看还是晚了一步。基德在逃离途中，却被神秘的杀手狙击，坠海失踪，生死不明。 柯南以新型滑板追踪，夺回彩蛋。与此同时从国外回来的香阪夏美小姐，从祖母的遗物中发现彩蛋的原稿图与实物不同。
柯南看了原稿后，认为彩蛋有两颗，而在彩蛋的玻璃上映照出夏美曾祖父所盖的城堡，所以大家，包括对彩蛋虎视眈眈的研究者决议要去此城探索 ，找寻第二颗彩蛋。在返回东京的船上，摄影师寒川被杀，而且和基德相同是被击中右眼。
目暮带着白鸟赶到，调查后柯南发现凶手可能是职业杀手史考兵。而白鸟却几次揭穿柯南的提示，使小兰对柯南的身份起了怀疑。到达东京后，大家前往城堡，阿笠博士为了送做给柯南强化的眼镜，与灰原哀 也一同出发至城堡，不料少年侦探团也藏身在车上跟踪而行。
在城堡中，柯南意外发现通往地下室的通道，在秘道中珠宝商乾被杀。而其他人在一个棺木中发现了第二个蛋，并明白了回忆之卵的真正含义。但专门狙击人右眼的神秘杀手“史考兵”也在人群之中。他再次行动，目标是小五郎和小兰，刺杀失败后凶手抢走了彩蛋，并想烧毁城堡。
柯南追赶凶手，在熊熊大火中，凶手露出了她的真面目。柯南在白鸟的帮助下逃出了火海。回家后小兰对柯南的真实身份再次起了疑问，正当柯南要说出真相时，新一出现了。
2、《名侦探柯南：瞳孔中的暗杀者》
《名侦探柯南：瞳孔中的暗杀者》是由儿玉兼嗣执导，高山南、山崎和佳奈、神谷明等人参与配音的动画电影。于2000年4月22日在日本上映。该作品是《名侦探柯南》的第4部剧场版电影。
剧情简介
专针对警察的连续杀人案件发生了，已经连续两位东京警视厅的现任刑事惨遭杀害，而遇害的两位刑事都手握警察手册气绝身亡。 这意味着什么，是对付警察的恐怖行为、或是过激派的暴行。警视厅正对此凶杀案件有关的人事物及警察组织内部着手进行搜查。 而警视厅的内部秘密却如高墙般难以窥探。
柯南与毛利小五郎前往警视厅向目暮警官、白鸟警官查询有关杀人事件的情报，但他们却意外地守口如瓶。在小五郎努力追问下，却得到白鸟警官一句：Need not to know（无须知道）这是警察之间所用的密语，也就是说杀人事件与警察内部有关。
毛利小五郎、柯南和众多警察参加白鸟警官妹妹的婚宴，席间突然停电，小兰和佐藤美和子警官都在厕所中，正当小兰拿起身旁的手电筒时枪声却响起，而佐藤警官也为了保护小兰而挨枪。听到枪声的小五郎等人涌入厕所时犯人却已不留痕迹地脱逃了。
这时，小兰却因承受不了佐藤警官重伤昏迷的打击，从而患了逆性健忘！虽然记不起身边的事，但却可以照顾自己的日常生活。失去记忆的兰不断受到犯人的攻击，为了找回记忆，众人带兰去热带公园，却误认为找到真凶而放松警惕。
此时，找出真凶的柯南赶往乐园保护兰，最后在喷水池中，兰想起了以前和新一的事，找回了记忆，并狠揍了一顿犯人。最后在大家的帮助下，犯人成功抓住。
3、《名侦探柯南：通往天国的倒计时》
《名侦探柯南：通往天国的倒计时》是由儿玉兼嗣执导，高山南、山崎和佳奈、神谷明等人担任主要配音的动画电影。
该片是《名侦探柯南剧场版》的第5部作品。于2001年4月21日在日本首映。
剧情简介
柯南一行人在露营的回家途中顺道参观一座位于西多摩市境内即将在近期完成的全日本最高双塔摩天大楼。而这摩天大楼的拥有者同时也邀请了小五郎与小兰前来参加开幕典礼，因而与柯南一行人偶然巧遇。
一行人在秘书的带领之下参观了这座两栋几乎一模一样的最尖端高科技双塔摩天大楼。但是，此时在这摩天大楼里却出现了多位与此建筑物有着不同关系的人士，不久之后第一个杀人事件发生了。而且，令人不敢相信的是黑衣组织的成员竟然同时也在大楼附近出现，
这让人不免联想到灰原哀自从那些日子以来，在深夜里究竟是在跟谁联络。 而柯南的真正身份会被组织发现吗，且灰原哀真正的身份又是？不管目暮警官等人如何的劝说，双塔摩天大楼的开幕典礼仍按照预定进行。
为了查出这场发生在总楼层高300公尺的高科技摩天大楼的杀人事件真相，柯南将与其宿敌，也就是当初逼迫工藤新一喝下毒药使他身体缩小的凶手——黑衣组织，展开一场史上最恐怖的攻防战。
4、《名侦探柯南：贝克街的亡灵》
《名侦探柯南：贝克街的亡灵》是根据日本漫画家青山刚昌创作的漫画《名侦探柯南》改编的系列动画电影的第6部作品。影片讲述了少年侦探柯南挑战虚拟体感游戏过程中追寻解开杀人事件真相的线索并活跃行动的故事。影片于2002年4月20日在日本首映。
剧情简介
在信息技术行业的帝王托马斯·辛德勒的基础上，开发了人工智能程序“诺亚方舟”的10岁天才少年弘树离奇自杀。2年后，辛德勒公司发表了使用了最新的虚拟现实技术的前所未有的游戏“茧”。这是可支配五感，体验就像现实中事情的虚拟体感游戏。
柯南、小兰和少年侦探团一起，前往发布会。在那里也出现了与这部游戏开发有关系的新一父亲——优作的身影。然而在华丽的聚会开始之后，辛德勒手下“茧”的开发负责人——坚村被杀害了。发现了坚村留下的信息的柯南，直觉感到优作负责的“茧”的舞台中隐藏着线索。
少年侦探团和灰原、小兰、警视副总监的孙子·诸星等人一起，向夏洛克·福尔摩斯和混合了真实存在的杀人犯开膛手杰克的“古代伦敦”发起挑战。可就在游戏开始的同时，游戏被“诺亚方舟”控制了……
5、《名侦探柯南：迷宫的十字路》
《名侦探柯南：迷宫的十字路》是《名侦探柯南》的第7部剧场版动画，由儿玉兼嗣执导，高山南、山崎和佳奈等人配音，于2003年4月19日上映。
剧情简介
在东京某个位于西国立市的神社内，有三名可疑的男子正在密谈。突然有个戴着假面具的黑影男人出现，用日本刀和弓箭在瞬间将三人杀害;与此事件同时，大阪、京都也相继发生了杀人事件。警方在经过调查后发现，
被杀害的五人都是出没于东京、大阪、京都三地，专门偷窃著名佛像及艺术品的窃盗集团“源氏萤”的成员。这个集团以日本历史上最有名的悲剧武将——源义经的故事《义经记》为名，首脑化名“义经”，部下则以“弁庆”为首，各自以家将姓名相称。
另一方面，小五郎带着柯南、小兰和园子来到了京都。八年前，位于京都的古老寺院——山能寺中的一尊国宝级佛像遭到偷窃，寺院的住持委托他们解读一幅可以判断佛像藏匿地点的谜样的画像，因而请来了小五郎帮忙。
瞬间躲过袭击的柯南，看到那名男子后感到十分惊奇。那个男子竟是与工藤新一并称的西部高中生侦探——服部平次，同时也是少数知道柯南就是工藤新一的人物之一。
他也是为了追寻在大阪发生的窃盗集团成员被杀事件的真相而到达京都，总是在较劲的柯南与平次，这次为了查出事件的真相，决定联手进行调查，但是，两人万万没想到，戴着面具的黑影男人居然就出现在他们面前。
6、《名侦探柯南：银翼的魔术师》
《名侦探柯南：银翼的魔术师》是由日本东宝公司于2004年4月17日推出的动画电影，该片是《柯南剧场版》的第八部。由山本泰一郎执导，高山南、山崎和佳奈、神谷明等人担任主要配音。
剧情简介
演员牧树里所拥有的珠宝“命运的宝石”被锁定成为目标，预告函的署名是怪盗基德。但是，预告函为什么是送给工藤新一，基德会再次在柯南面前现身吗，惨剧的真相到底是什么，26个文字、滑道、怪盗基德，这一次的谜题是什么，关键又会是什么。
某天，毛利侦探事务所接到了知名舞台剧女演员牧树里的委讬。委讬内容是牧树里收到怪盗基德预告信，信中指出怪盗基德将在舞台上夺取牧树里佩带的蓝宝石戒指，“命运的宝石”。于是毛利小五郎接受保护宝石的工作，依据毛利小五郎的推理，
基德将在演出的最后一天前来盗取这颗无价的宝石。在演出的最后一天，毛利小五郎、小兰和柯南受邀观赏舞台剧，在剧场里错综复杂的人群中，基德到底会假扮成谁出现在大家面前，在紧张的埋伏等候中，出现在大家面前的竟然是工藤新一，柯南一方面必须保护宝石，
另一方面又不能拆穿基德假扮的工藤新一，因为拆穿基德就等于公开自己身体缩小的秘密。柯南只好盯紧假的工藤新一，一刻都不能松懈。就在舞台剧即将落幕之前，柯南发现假的工藤新一不见了，随即追上，但却在一片混乱之中来是让基德逃脱了。
不过，“命运的宝石”终究是保护住了，牧树里为了表示感谢，邀请毛利侦探前往北海道函馆的别墅度假，同行的还有一同演出的其他演员。
就在大家都搭上飞机前往函馆的机舱里，一幕精心设计的杀人剧码就在大家面前实际上演了。柯南除了要防止基德再度混入人群中，又要解开发生在飞机上的密室杀人事件，到底柯南要怎么行动。
7、《名侦探柯南：水平线上的阴谋》
《名侦探柯南：水平线上的阴谋》（名探侦コナン 水平线上の阴谋）是由日本东宝电影公司于2005年4月9日推出的一部侦探类动画电影。该片是《柯南剧场版》的第九部。由山本泰一郎执导，高山南、山崎和佳奈、神谷明等人担任主要配音。
剧情简介
15年前的一个雾色浓稠的夜晚，在北大西洋的海上一艘正在航行中的货轮“第一八代丸”，撞上了前方巨大冰川发生事故沉没。万幸的是船上大部分人都逃过这一劫难，只有船长和一名船上的高级干部不幸罹难身亡。
时间回到15年后的现在，地点是日本东京西多摩市的别墅密集区，八代财团旗下分属八代造成业的设计师八代英人，开车的时候心脏病突发，结果车子不幸掉下山崖造成车毁人亡。谁也没想到，时隔15年且分别发生在海洋和陆地上的两起事故，会是一项重大阴谋的开始。
镜头转到正在太平洋上航行的豪华客轮阿芙洛迪特号上，这是根据希腊神话中的代表美丽的爱神阿芙洛迪特的名字命名的。柯南、小兰和毛利小五郎受到园子邀请，参加这首船的处女航。理所当然，这么受到瞩目的豪华客轮，参加处女航的都是些政界、社交界的绅士名媛。
然而没多久，船上出现了可疑分子，园子更遭到袭击被其监禁，幸运的是根据柯南的推理顺利找回了园子，正在众人欢欣鼓舞的时候，却发生了杀人案件。被害者正是这次处女航的主办人，八代客轮的社长八代贵江，她是半个月以前车祸身亡的八代英人的妻子，紧接着八代财团的董事长，
贵江的父亲八代延太郎也从船上神秘消失，获悉此事的目暮警官带着一群警察上船来搜查，同时出动了东京海上保安厅的人对海上进行搜查，陆地上也有警视厅的人在八代英人出事的地点进行再搜查。与此同时，理所当然地我们的小主人公柯南也展开了他最擅长的推理。
而这次包括乘客和船上工作人员，总共有600名嫌疑人。于是柯南、毛利小五郎以及警方分别展开了各自的调查，与此同时，犯人也正展开他巨大的阴谋。
为了不影响乘客的情绪，船上的晚宴仍然如期举办。在柯南的努力下，真相即将被揭发时却突然发生了重大意外，油轮的机房发生了大爆炸。犯人更在整艘油轮的主要机房内都安置了炸弹，整个船身不停摇晃，让船员和乘客都惊恐万分，全船600条人命，就悬于疯狂的犯人一念之间。
置身于无处可逃的大海上，引起了极大的恐慌和混乱，人们陷入了极度的不安中。更糟糕的是，这次连小兰也被卷入了危险里面，当然，片子的结果，依旧是正义战胜邪恶，柯南用他名侦探的推理救出了小兰，不过出人意料的是，这次掌握事件关键的，却是新一和小兰超越了时间的羁绊。
8、《名侦探柯南：侦探们的镇魂歌》
《名侦探柯南：侦探们的镇魂歌》（名探侦コナン 探侦たちの镇魂歌）是由日本TMS公司制作，并由日本东宝公司于2006年4月15日发行的一部动画电影。该片由山本泰一郎执导，高山南、山崎和佳奈、神谷明等人担任主要配音。
剧情简介
一天毛利小五郎收到一张请帖，里面是谜样男子的委托，需要前往横滨的一个游乐场。小五郎和柯南一行人快乐地到达欢乐的游乐场，还带上了可以出入无阻代表VIP的手表，不料正中那名神秘男子的圈套。
所有带上手表的人不得离开游乐场，否则便会发生爆炸。从现在开始到晚上十点，柯南和小五郎如果不能解开谜题，兰和少年侦探团也会随着游乐园粉身碎骨。
其他侦探们与柯南一同挑战谜题，当所有人同时努力调查敌人的真面目时，危机不时展露眼前，时间一分一秒地逼近，敌人同时无赖地设下最后一道陷阱。然而更意想不到的是，那名男子居然直接称呼柯南为工藤新一。
9、《名侦探柯南：绀碧之棺》
《名侦探柯南：绀碧之棺》是由日本东宝公司于2007年4月21日发行的日本动画电影。该片是《名侦探柯南》剧场版的第11部。由山本泰一郎执导，高山南、山崎和佳奈、神谷明等人担任主要配音。
剧情简介
东京都，高木和佐藤抓到了两个抢劫犯，犯人说出了海盗旗三个字。画面转到了神海岛。毛利小五郎因为抽中了30万日元的奖金，原本想一个人去巴黎玩。但是最后只好带了兰、园子、阿笠博士和少年侦探团一行人来到了这个小岛。
这个小岛有沉入海底的古代遗迹，海底宫殿和300年前确实存在的Anne Boney和Mary Read两个女海贼遗留下来的宝藏的传说。两个月前有流言说宝藏被找到，引来了大批的游客和寻宝人，毛利也因此没能在酒店定到房间，他们被当地的观光课长岩永带到了经营民宿的美马和男家中。
少年侦探团们去参观了当地的博物馆，在博物馆有两件非常珍贵的物品，一把弯刀和一把手枪，是两个女海盗的武器。少年侦探团在岩永的建议玩寻找宝藏的游戏。另一边兰和园子去潜水，想去看海底宫殿。
他们在负责他们这次海底之旅的店中碰到了三个宝藏猎人，分别是松本光次，伊豆山太郎和一个男人。当兰，园子，和当地的导游三人潜入海底的时候看到那个男人被鲨鱼围攻，松本，伊豆虽然极力保护，但是那人还是没能被救活。
柯南调查发现那人的潜水衣下面有塑料袋的痕迹，是有人故意将鱼血放在塑料袋里，随着潜的越深，压力变得越大，塑料袋破裂，血的气味引来了鲨鱼群。
这次的事件使目暮警官，白鸟，佐藤，高木都来到了这个海岛，通过指纹发现松本是世界上有名的寻宝人，而且身上有很多案子，是一名国际通缉犯。海底有宝藏的传言真实性变得越来越高。少年侦探团们的寻宝游戏还在继续，博物馆传来两个女海盗的手枪和弯刀被盗的消息。
柯南调查时发现两个寻宝人在偷盗物品后遭人狙击。第二天兰和园子被那两个寻宝人劫为人质。台风来临，少年侦探团们的寻宝游戏中的暗号也终于都被解开，柯南发现民宿的主人美马先生曾也是一个寻宝人，在他的帮助下发现寻宝游戏的地图其实是按照真正的寻宝图画的。
解开暗号后，柯南得知宝藏应该在附近的赖亲岛的周围海域，但入口太小，只有小孩进得去。柯南在美马的帮助下也去了赖亲岛，去救兰和园子。园子的胳膊被刻意划伤，帮两个受伤的寻宝人引开鲨鱼，园子陷入鲨鱼群，兰拼命救园子，终于顺利逃离，进入海底宫殿。
毛利知道女儿的情况后试图救助，但由于台风，他们只能等待。松本，伊豆，兰，园子终于找到了女海贼所藏的海贼船，但是却没有宝藏，松本和伊豆想杀人灭口，在千钧一发之际，柯南赶到，岩永跟随柯南也来到了海底宫殿，所有的谜题也都揭开。
此时地震发生，海底宫殿就要倒塌，柯南利用甲烷引起爆炸，打破了宫殿的顶部，让海盗船浮出水面。台风过去，毛利一行人在海上等待，海盗船刚浮出水面就因为年代太久解体，掉入水中的6人被目暮警官一行人救起。
10、《名侦探柯南：战栗的乐谱》
《名侦探柯南：战栗的乐谱》是根据青山刚昌创作的漫画《名侦探柯南》改编的动画电影，影片于2008年4月19日在日本首映。
剧情简介
不久之前发生了以音乐家为袭击目标的连续杀人事件，被害人均出身于原著名钢琴家领衔创建的一所音乐学院。柯南等一行人，受到了这位钢琴家的邀请，出席由他出资建造的音乐厅的落成典礼音乐会。
音乐会的亮点是巴赫弹奏过的管风琴和世界著名的斯特拉迪瓦里琴的音色，以及拥有绝对音感的天才歌手的歌声。可是，在音乐会正式举办前，陆续发生了许多可疑案件。而正式演出当天，柯南他们所在的音乐会会场突然发生了爆炸，陷入一片火海。
M4瞳孔中的暗杀者
M5通往天国的倒计时
M6贝克街的亡灵
M7迷宫的十字路口
M8银翼的魔术师
M9水平线上的阴谋
M10侦探们的镇魂曲
M11柑碧之棺
M12战栗的乐谱
