名侦探柯南日版
1、第001话 云霄飞车杀人事件
高中生侦探工藤新一被称为“日本警察界的救世主”而响誉全国，他帮助警方解决了很多棘手案件。
某日，他和青梅竹马小兰一起去坐云霄飞车时遇到了一起因情生恨凶杀事件，其中，有两名黑衣人引起了工藤的注意，工藤暗中跟踪却被发现，黑衣给他灌下毒药后离开，当被警察发现时，工藤已变成了小孩儿的模样。
2、第172话 飞天密室
小兰在去冲绳旅行的飞机上想起了一年前新一在飞机上首次处理命案的事情，当时正值深夜，飞机上所有的人都在睡觉，突然传来一声尖叫，一名叫大鹰的男子在厕所被人杀害，碰巧目暮警官也在飞机上。
于是新一和目暮警官一起对机舱上所有可疑的人进行了调查，在寻找凶器无果后，新一想到凶器一定就在凶手身上。
3、第173话 飞天密室
新一要求在次对嫌犯的物品进行搜查，可依旧没有发现可疑物品，之后，新一在鹭沼的座位上发现了底片的碎片，并将所有人的证词、座位上的底片、墙壁上的血渍和被害人口袋被弄湿都串成了一线，虽然鹭沼的嫌疑最大，但新一却说凶手不是他，因为他被真凶所利用，推理一步步接近真相。
4、第308话 工藤新一的纽约事件(事件篇)
解决了横滨中华街的命案之后，小兰突然倒地不起，在发高烧的情况下想起过去碰到的命案。
那是与新一去纽约时发生的事情，有希子带他们两人一起去看话剧，在剧场门口与明星莎朗汇合后，大家一起去参观开演前的舞台陈设，不想这时却发生了意外，盔甲服装从天花板上坠落，而其中一名女演员却无法躲避，危机时刻，小兰挺身而出。
5、第309话 工藤新一的纽约事件(推理篇)
幸运的是两人都没有受伤，演出也能顺利进行。然而，就在大家惊讶于华丽的舞台和逼真的场景时，烟雾缭绕剧场内却发生了命案，死者是话剧的男主角。
案发时，新一立刻跑到舞台上并在那里发现了手枪和空弹壳，之后又想起了出现在舞台上的红色瞄准线，但他却不认为凶手是从观众席杀人，反而肯定凶手当时就在舞台上，而嫌疑最大的就是和男主角纠缠不清的四名女演员。
2、第49话：外交官杀人事件（下集）
3、第162话：空中的密室·工藤新一首次推理
4、第190话：危命的复活——第三个选择
第191话：危命的复活——黑衣骑士
第192话：危命的复活——新一回来了
第193话：危命的复活——约定的场所
5、第219话 名侦探的会集！新一vs怪盗KID(2小时特别节目)
6、第286话 工藤新一NY事件（事件篇）
第287话 工藤新一NY事件（疑惑篇）
第288话 工藤新一NY事件（解决篇）
7、《名侦探柯南》剧场版之第3弹：《世纪末的魔术师》（这部中，“新一”虽登场，但
却是由KID假扮的）
8、《名侦探柯南》剧场版之第7弹：《迷宫的十字路口》
9、《名侦探柯南》OVA1：柯南 vs Kid vs Yaiba 宝刀争夺大作战（不是吃药变大，只是
柯南在做梦）
10、第345话 直面黑色组织的对决!满月之夜的二元神秘事件（这部中，“新一”虽登
场，但却是由服部平次假扮的）
还有他第一次破案（在飞机上的那集），剧场版《迷宫的十字路》
工藤新一
有新一出场，以及柯南变成新一的集数：
柯南变新一的集数：
TV049 外交官杀人事件(后篇)
TV190 危命的复活 第三种选择
TV191 危命的复活 黑衣骑士
TV192 危命的复活 新一回来了
TV193 危命的复活 约定的场所
剧场版
第7弹 迷宫的十字路口
附：
有新一的集数
TV001 云霄飞车杀人事件
TV048 外交官杀人事件(前篇)
TV049 外交官杀人事件(后篇)
TV162 (特别篇7)飞天密室 工藤新一最初的事件
TV190 危命的复活 第三种选择
TV191 危命的复活 黑衣骑士
TV192 危命的复活 新一回来了
TV193 危命的复活 约定的场所
TV219 (特别篇11) 被召集的名侦探 新一 VS 怪盗基德
TV286 工藤新一NY事件(事件篇)
TV287 工藤新一NY事件(推理篇)
TV288 工藤新一NY事件(解决篇)
TV345 （特别篇15）直面黑衣组织的对决——满月之夜的二元推理（不过这个新一是平次装的，嘿嘿，不过这次装的暴像……）
TV400 心存疑惑的小兰（新一的出场在小兰的回忆中）
剧场版
第3弹 世纪末的魔术师（这个是KID扮的）
第7弹 迷宫的十字路口
第8弹 银翼的魔术师（这个新一是KID装的）
第9弹 水平线上的阴谋(小时候的)
OVA：
之一《柯南 vs Kid vs Yaiba 宝刀争夺大作战!》
049 外交官杀人事件(后篇)
162 飞机空中密室！工藤新一的首次的办案
阿笠博士抽奖抽中了旅行券，小五郎、小兰和侦探团去了冲绳，在飞机上小兰梦见了以前和新一去洛杉矶的飞机上发生的杀人事件。那么这就是最初的一页……
190 生死一瞬间（危险的复活） 第三种选择
柯南正在为是否告诉小兰自己的真相而烦恼时，当天夜晚，灰原出现在了柯南的病房并把枪口对准了柯南！同时小兰的学校正在准备文化节，柯南也去看了小兰主演的话剧。但是观众中的一个男子突然倒下死了。
191 生死一瞬间（危险的复活）黑衣骑士
在小兰主演的话剧的表演中，发生了杀人事件。目暮警官认为被杀害的蒲田的饮料中被他的同伴们下了毒，但是从现实情况来说准备断定是自杀。此时出现了意外的人物！
192 生死一瞬间（危险的复活） 新一回来了
变回原来的身体的新一回到原来的生活的时候，在米花中心大厦的了望餐厅邀请兰吃晚餐。晚餐时听说在餐厅的电梯里发生了杀人事件的新一对兰说“马上回来”，奔向了案发现场。
193 生死一瞬间（危险的复活） 约定的场所
新一明白了在米花中心大厦的电梯里杀害社长的犯人，但是身体开始发生变化，另一方面小兰在了望餐厅一个人等着新一的回来。
219 被召集的名侦探 工藤新一 VS 怪盗基德
打算拿取铃木财阀的黑珍珠BLACK STAR的怪盗基德，想起了以前关于钟台的一个事件。另一方面，小五郎的事务所里受到不明发信人的信函，而且里面装着支票。小五郎带着小兰、柯南一起到了“黄昏之馆”。“黄昏之馆”是大富翁乌丸莲耶的别墅，一同被招待的还有其他名侦探。而后开始了在馆中寻找财宝的游戏。但侦探在一个一个消失。最后留下来的侦探是？召集侦探们的犯人的真实身份是？（严格的讲这一次应该不算，因为新一依然是以柯南的身份出现的）。
286 工藤新一NY事件(事件篇)
287 工藤新一NY事件(推理篇)
288 工藤新一NY事件(解决篇)
柯南解决了横滨中华街的事件，但小兰发起高烧病倒了。在意识恍惚中，小兰的脑海中浮现了带着黑帽子的男子赤井、新一、及美国女演员莎朗·温亚德的形象。小兰想起了以前是在纽约，自己和新一遇见莎朗.温亚德并遭遇到事件的时候见过赤井。那是2人前去见住在美国的新一父母时候的事情。新一的妈妈有希子开着“美洲豹”疾驰在纽约的街头。她拿到了在百老汇好评如潮的音乐剧《金苹果》的入场券，正赶往剧场前去观看。
400 心存疑惑的小兰（回忆）
近期小兰越加怀疑柯南就是新一。柯南放在那里的手机被小兰给看到，她想从手机的邮件确认自己的怀疑。小兰在开机画面中发现手机被锁定了。正想解除密码暗号的时候，外面有汽车喇叭的相声，小兰看到那车的号码是46-49（yoroshiku），想起半年前与新一约会的事情…
437 上户彩和新一 4年前的约定(回忆)
柯南、兰与打扫工藤家书库的园子，留意到一张根据优作的著作而拍成了电视剧的“女高中生侦探YUKI的事件簿”的照片。照片上有与新一、兰同样是16岁的上户彩。听兰说，这是4年前首次担任主角的彩来拜访优作时拍的照片。
之后，一名年轻女子来到了工藤家。那人正是上户彩，原来她有事来拜托新一……
472 少年工藤新一的冒险（前篇）(少年)
473 少年工藤新一的冒险（后篇）(少年)
柯南等人正在帝丹小学的图书室读书。此时，小林老师在书架的空隙中发现了什么。那是个破旧的皮革钱包，中间放有1张纸。柯南对这个钱包有种似曾相识的感觉…。10年前，小学一年级的新一和小兰为了查明学校有妖怪出没的流言的真伪，在满月之夜潜入小学的图书馆中。在那里，新一从谜样男子那里得到了这个皮革钱包，并接受了解读纸上记录下的暗号的挑战…
柯南在图书馆继续诉说着对那个钱包的回忆。10年前，接受谜一样的男子挑战的新一与小兰，阿笠博士一起破译了第1个和第2个暗号，第3个暗号“消除OKUHO的证据 用混浊的声音紧咬住孤独”。新一破解出暗号的前半部分后前往奥穗邮局。由于前2次都是将暗号隐藏在红色的东西上，所以新一直奔红色的邮筒而去，打算寻出端倪…
490 服部平次vs工藤新一 滑雪场的推理对决（中学）
剧场版
第7弹 迷宫的十字路口
新一
[番外]-TV.010 足球选手胁迫事件(被量子说和新一有过，实际没有)
